Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SCG3-1:1

Sequence Length

581 nt

GC Content

0.4269

AUUACAUAUCUGAAUCACGAGGCAUUUAGGACGGGAAUGAAAAGAAGAUCGGGGGAGGUGUUUUAAAAACCAGGUUCUCCUCUUAGCUUGACCAUUCAGGAGCUGAGGGACCUGGGCAAGUCCCUCCACCUCUCUGGGCCUCUGCAUGUAAAGGGGCGUUUGGGCUAAAUGAUUUGUAAACCUCUGUUCUUCCAAGAUUCUCCCCUCUCAGGGAACUGAAAAGAUGAGAGUGUUUCUGUUUAACAGCACUACAAAAAGCCUAAUUGUGACAACAAGCGCCUCUACCCUAGUGAGGAGGAAAGAUUUUUCAGAGCUUCAGCAAUCUGAUUUUUUUUUAAAGAUAAAACUGAUUUUCUCGAUCGACUCUCUUCAGUCUAACCCAAUAAAUACGCAUUGCAAUCAUUUUAAUUUUUGUAAGAUCUUGAUGGGGAAAACAGAGGGAAAGAACACCUAAAACACGAGAUUAUUCCACAACCAAGGACGAAAGAGAAAUAGCUUUGACUGAGGGCUUGCGCUUGCUAGACACUGCGCCUAAUAUGUACAUGGUCACCUUAAGUGUCACCUCAGCCUUCUGAGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-146 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -158.92

Frequency: 0.0000

Diversity: 190.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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