Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SH3TC2-1:1
Sequence Length
1704 nt
GC Content
0.3862
GGAGGUUCAGAAGAAAUAGCACAGAGUGAGGACAGCAGAGGUAAACAUGCCUGCAGAAACCUUUCUCUUGGCAUGCAGAGCAAAUACUAUAAUCCAGGUGUCUCAGCCAAUGAGGCAUUUAAACAGAUACAGAAAAAUCAUUAAAGAGGAUUUCAGAAGGGUAUGCUCACCUGGACAGAUUGCACUCCAUCCUUCCAGUGUCUCCUGAACUGCUCUCCAGGAAUCAUUUUCAUCAGAAUCACUGGGGCAUUUAUGAUUCAAAAAUGCUUUGAAUGUGGCAGUGCCUGAAUCUACAGUUUUCCAUGUGAUUUUUAGAUAUACUAAUGUUUGAGAACCACUGCUGUCAACAGCAUAAUUCUGUAAGAUUCAAAAUACUAGUUGUAAAGAGUUAAUUUAGCUGAAAUGCAAAUUUUGAUUUGACCUGCUCCCAAUUCCAGACCUCUGAAAUCAGUAAUGACAAGAACCUUUGGGCAUUUUCAGGCUCAGUCUUCAGAGGCUUAUCCUAUAGAGAAGAGGAAUAAUUUCUGUAGCCACAUCCCAAAGUAGGGGAGAUGGGCCACUAGGUACACAGCUGCCUUUGUGAAGAAGCAGAGUAGGAAAUAUCUACCCUGCAAUGAUUGGGGCACAGGAAAGCUGGAAUCCACCUUAUUACAACAGCUGGUUAAUGUCAUACUGUGAACUCAUUGAGCACCUGCUUUGUGAGUAUUCAUUUUCUAUUUUUAAAUUUUGCAUCAACCUUGUGAGGUUUUUGGUAUGUUUAUCUCCAUUAUACAGAUGAGGCUGCUGAGGCUAAGAGAAGUCAAGUAAUUUGCCCAAGGUCAUAUUGGUAGUUAAUAGAACUAGGACAGAUUCCAGGGUUGUGGUUUGAAUCAGGGGUUGGCAAACUAUCUGGCCCACUGCCUGUUUUUGUGUGGCUUGCAAGCAAAAAAAAAGAUGUUUACAUUUUUUAAUUGUUCAAGAAAAUCAAAAGGAGAAUAAUAUUUUGUGACAAGUGUAAAUUACAUAAAAUUCAAAUUUCUAUGUCCAUGUAUUUAGUUUUAUUGGAACACAGCCAUGUCCAUCAUUUAUGUAUUGUUAAUGGCUGUUUUCAUACUACACAGCAGAGUUGAGUAGUUGUGACAGUGACCUUAUGCUCUUGAAAGCCUAAAAUAUUUGGUAAAUAGCCAUUUACAGAAAAAAGUGCCACCUCCCACUUGAACCAUUAUGCCUGCAUUUCUCAAACUUCAGCCAUUUGAAUUCUACUCCUUCAUGAUUCUUGCCACCUUUUCAUACCAUCUGGAACAUUAACUGUGUGACAUUUUUCUUUAGAUCAAUUAAUUUUCCUUAAAUAAAUUUAUUUUAUAAAGAAACAAAAAUGAAAGCGAAAACCAGUACCAAUUGCAAGAAAUAGAAGAAAACUGUAAAAACAAAUACAAUAUACCAAGAACAGUGUAUUCAUAUUAGAUUUCAGCUAAAUAGCUGGAACAGACAAUGUUGGUGUUGCUUCAUUUCCCUGCAGAUCCCCUGACCAUUUCUCUGUAAGCCAUCAGACUUCCAAUGAUGGACCUGAAACAUUUUUGGAGGGCUGCUCUCAGUCUACUGGAAUCCCCUUUGCACACAAGCACAAUAAAUUGGGGGUGCCUGAGAAUCCAAGUUCCACUGUGGAUAGCUCUAACCAACAAAUUGUGGGUGCGGGAGUAUCCACAUCCCACCUUCCUAUCCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-439.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -473.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 465.7
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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