Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A11-10:10
Sequence Length
1739 nt
GC Content
0.3732
GGAAGGCGGGGGACCCGGGACUUCCAAGUGUUCUGGCCAUGGAGGCAUGGUAUCCGUAACAUCCCCCAAAGGAGCUAAAGAAGAAAUCCACAAUUUACCAUGAGCAUUUCUCGUCUGAAGAUUGCCAAGCGAUUCCUCCAGGACAUUCCUCAAGAUCAAUUUCUGUUCAUCCACCUUGUCCUGGGAGGGACAUCAAUGGGUUUCCAUGUCCUUUGGCUUCUGGUUGAGUUCACUCAGUGGAGAACCCUGGCAAGAGGCAGGAAAAGGGGAGGAAGGCUUUAUGAUACAUGUGUUGAAUGUGCAGGUUCGUUACAUAGGUAAAUGUGUGGCAUGGUGGUUUGCUGCACCUAUCAACCCAUCACCUAGGUAUUAAGCCCUGCAUGCAUUAGCUAUUAGUCCUGAUGCUCUCCCUCCCCCGCACCCCCUAGCAGGUCCCUGGUGUAUGUUGUUCCACUCCCUGUGUUCAUGUAUUCUCAUUGUUCAACUCCCACUUAUGAGUGAGAACAUGCAGUGUUUGAUUUUCUGUUCCUGUGUCAGUUUACUGAGGAUACUGGCUUCCAGCGUCAUCCACGUCUCAGUAUAGGACAUCAUCUCAUUCCUUUUUAUGGCUGCAUAGUAUUCCAUGGUGUAUAUGUAUCACAUUUUUCUUUAUCCAGUCUACCAUUGUGGGCAUUUGGGUUCAUUCCAAGUCUUUAAUAAGGGUUUGGUCUUACCUGAUUUAUGUUAGAAGGAAACCAUUUGUUUGGAAUGAAUAGAGUAAAUCUUUUGGGAAAAUAGAAAAAAAGAUUAUUUUAAAAUCAUGUGAAUAUUUAGGUCUAAGAGUUGUCCAUGAAUCCUUAGCUCAGUGUUCAUAGAUCCCUACAAACAAGAUCUAUGAAUAGAAUUCUUGGAAUCCUUAAGUUAGGAUAGGAAAAAAUUACAUCUUUAUUUUUUCUAACCUCUAUUUGAAAUGUAGUAUUUCUUUCCAUCACAAGUGUAUGUGACAAGACACAAUAGUGUUGGUCAUUACUAAGGCUUUAUCACCGACAAAAAUCAUAGGUAUUUUUAUAUCACACUGCAGUGUUGUAAAAAUCUCAAGAUAUCAUCUAUACUCUUCACUGCUUCGAAAUUAUGGUAGUUGGUAGACCCACCUUCAGGUCUUGUUAUUGGCGGCAUUAAUAAGGAAGUGUAUAUGUUAUGUUUCACAAUUUUAUUUUCUAAAUACUUUCAGAUUGCAACUGCAUUUCCAUAUAAUUUAUUUUAUAAUUCGUUGUGUUUCAAGUUAUGCAUUUACACAUGUAAUUCUAAAAAGAAGUCCAUAGACUUGACCACAUUUCCAAAAGAGUUCACAGUAAACAAAUUAUUAAAAAUCUCUGUUAAUUCAUAGAUACUCAUUCCAGAAAAUACAGCAAUGGCUGCAUAUCAGGAAUAUCUUUUUCCAGAAAAAAAAAUAUCCGAAGUUACUAGAUAUUCUGUAGUUUCUGUAUGUGGAGUUUCUGGGGUAAAUCCUUUGAGUUCAAUAUGUUGACUAUGUGCUAUGUCAUCUCAAAUAUUUGACCUUAUUCUGUUUUUCUUCUCUGGGUCAUUGUAUGUUUUGUAACUAGAUUUCCUAUUUGGUAUUUGUCUCCCAAAUUUUAAGAGCAAAACUUGUCAUCUAUCGCCUUAUUUUAAUUCUCACUAUGUAAACUUGUAAGAACUAACUCACAACUUGGUGUCUCAUAACUCACUUCUGAAAUAUCCAAUAAAAAACUGCCAAGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-421.55 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 418.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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