Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-10:14

Sequence Length

769 nt

GC Content

0.4538

GAAGGCGGGGGACCCGGGACUUCCAAGUGUCCAAAAACAAUCCAUUGAUACACUUGGUGACAUUAAUUGAGAAAAAAACAAUAUGGUCUGGCCAUGGAGGCAUGGUAUCCGUAACAUCCCCCAAAGGAGCUAAAGAAGAAAUCCACAAUUUACCAUGAGCAUUUCUCGUCUGAAGAUUGCCAAGCGAUUCCUCCAGGACAUUCCUCAAGAUCAAUUUCUGUUCAUCCACCUUGUCCUGGGAGGGACAUCAAUGGGUUUCCAUGUCCUUUGGCUUCUGGUUGAGUUCACUCAGUGGAGAACCCUGGCAAGAGGCAGGAAAAGGGGAGGAAGGCUUUAUGAUACAUGUGUUGAAUGUGCAGGUUCGUUACAUAGGUAAAUGUGUGGCAUGGUGGUUUGCUGCACCUAUCAACCCAUCACCUAGGUAUUAAGCCCUGCAUGCAUUAGCUAUUAGUCCUGAUGCUCUCCCUCCCCCGCACCCCCUAGCAGGUCCCUGGUGUAUGUUGUUCCACUCCCUGUGUUCAUGUAUUCUCAUUGUUCAACUCCCACUUAUGAGUGAGAACAUGCAGUGUUUGAUUUUCUGUUCCUGUGUCAGUUUACUGAGGAUACUGGCUUCCAGCGUCAUCCACGUCUCAGUAUAGGACAUCAUCUCAUUCCUUUUUAUGGCUGCAUAGUAUUCCAUGGUGUAUAUGUAUCACAUUUUUCUUUAUCCAGUCUACCAUUGUGGGCAUUUGGGUUCAUUCCAAGUCUUUAAUAAGGGUUUGGUCUUACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-220.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -234.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 228.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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