Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-10:20

Sequence Length

567 nt

GC Content

0.4480

AAUUUGCGAAGUGAGGACACUAUCACAAGAUCCAAAUCAAUGUCCUUCCGGGAGAAUUUCUUAAAAUCUUGUUUUCUCUCGUUGUCUUCGGAAGAAGCCCGACAUUUCUUAUAGGAAAUGGAACUCUUCAUAAGUCUGGCCAUGGAGGCAUGGUAUCCGUAACAUCCCCCAAAGGAGCUAAAGAAGAAAUCCACAAUUUACCAUGAGCAUUUCUCGUCUGAAGAUUGCCAAGCGAUUCCUCCAGGACAUUCCUCAAGAUCAAUUUCUGUUCAUCCACCUUGUCCUGGGAGGGACAUCAAUGGGUUUCCAUGUCCUUUGGCUUCUGGUUGAGUUCACUCAGUGGAGAACCCUGGCAAGAGGCAGGAAAAGGGGAGGAAGGUGAAAACCAUCCAUUUCUUGGAGAAGUGCCACGGUGGGGUUGCAAGUCCCAGGAUCAAGUUUUCGAUGUGUCUCUUUUUCCCGUAAAGUGGCUGAAAUCUGAAGCUGAAUCUGCAAGUGUCAUGGAGUCAUUGAAUCUCACAGUCUCAACUGAUAAAAGUUAUUAAAGGUCGUCUGGUUCAGCCUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-155.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -168.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 143.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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