Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A11-10:29
Sequence Length
3032 nt
GC Content
0.4644
CUGGCCUGAGCUCCGGACUCCGGGGACAGCGCGUCCUGUCCCGAGGGCCUCCCGCCCCCCGGGAAGGCCAAGGUCAUGAGGUCAAACCCCAACUUUUGGGCUUCCGCGAGAGUAAAGCCCCCGGAUGGUCCUCGGAGCUGUGACGUCACAAAAAGUGCUUGGGGUCUGGUUUCCCGCAGAAUCCAGCCUCUGUCCACGUGAACUCUGCUCUGUCCUCUGGGCUCAUAAUGUUCUGAGACUCUUGCUGCCUCUUUCAUGGAUUCCCCUUCUAUUUCCCUGAGACGACUCACAGGUCACAGAAAGCUGCCUCCCAUCCUUGCGGCUCCAUCAAGGUGCUUUGGAGGCAGGUAAAGCGCAGCCAAAAACAAUCCAUUGAUACACUUGGUGACAUUAAUUGAGAAAAAAACAAUAUGGUCUGGCCAUGGAGGCAUGGUAUCCGUAACAUCCCCCAAAGGAGCUAAAGAAGAAAUCCACAAUUUACCAUGAGCAUUUCUCGUCUGAAGAUUGCCAAGCGAUUCCUCCAGGACAUUCCUCAAGAUCAAUUUCUGUUCAUCCACCUUGUCCUGGGAGGGACAUCAAUGGGUUUCCAUGUCCUUUGGCUUCUGGUUGAGUUCACUCAGUGGAGAACCCUGGCAAGAGGCAGGAAAAGGGGAGGAAGCAGCCUGACCGGUUUGAAUUUCACCUUCUGUUCACCUUGGAUGAGAGCAGUAAUCAUCACGAUCCCAGGGAACAGCCAAAGGAAGAGAAAAGGCAAAAGAUUUGGACAAGACUCAUGAAGACUAACAGCUCUUGGAUAAUUGAGAGAAGGCAGCUGCGUGAACAGUUUUGAUGCAAUCAUGAAGGCAGGGCCCAGUGCCUGUGGCAUCUGCCUUUUUCUGGAACCAAUCCAUAUUUCCUUGUGGUUUUCUAAGGUGCAGAGAGGGCACAUUGGGAACUUUGCUUGGGGUCUUUUUCACAUCUUAGAGGGAAGGUCCCUCAACAUCUGCAUUGGCGGAGUGUGAUCCUCAUGUCCCUCUGAAUGAUCUGGACUUGAGGUAACCAGCCCCUUCCAGGAAGCUGUCCCAUGAGUGAAGCCUCAGCAGCAGCCUCUGUCAGUCCCUCCCCCACAGAACCUUUGGCUUCCAUUUGACCAGCCUUGACAUCCAGUGUCCAAACACCGAUAAAAUUGAUUCCACUAAGCGUGGGAAAGUCCUGGAGCAUCGAUUGUUUCCUCCUCUGCACCCCCGAUACCCUGGCAUUAGCACUCUCCCAGAAUGUACCUUGCUUGUUUGAUUGGAGGAGGUCAAAGCCCUGAUGAAGAAUGAGUGGAAUUCCACAGGAUUGGAGCAGUCUUGAUAAAUGACAGCAGGGGAUGGUGUGGGGAGGGGAAAGGAUCAGAGGAAGUGUGGAUAAAUGAAUGGCUUAAAAAAUAAUCCACCUUUGCCUCCCCCUUUUCUACCAGUCUGUCUAGUGCUUCAGGGUGAAAAAAAAAAAAAAAAGCUUGCCUUUCUAAACAUUUGGAGUUUCAGAAAUGAUCUAUAGAGCAUGUUUAGUUUUUCAAGUUAAAAAUAUUAAAAGAAAAAAAAUGUUUGAGGGCUUUACUGCUUUCCCGCAAAGAGCUAGAGCCACCCAAGCAGGAUUGACUGUCAUUGGUUUGAGGUUUCUGUUUGCUUUGAGGCUAUUUUUUCCUUAGUGCUAUAAACUAGAUCAGUCCAUUUUUAGCUGAUAACCCUUUCCAAUUUCGCUGUGAAAUGAGGGGCUGGUUGGGUGGUUUUUUUUUAUGUUCUUUCCAGCGUUGACUUUUAUGGUCUUUGAUUCCAAGGUACCUCGUCGACUCUGAAGACGAGAGAUGGGUAGGUUCUAACUCCAGAUGAGCCACUGCAAGAUGGUACCAGGAUGAGAUAGAGAGUCUCUGUACUAUCUUUUAUAUGUUCUCAAACCCAGCCAGGGAUCAGAGUGACAAUAUAACAUGGGGAAUCAUAGAGAUGUUUAUGGUAAUUCUGCUAUGAGUCAACUGAGAUGUCCCUUAUGGAGAUAACUUCCCAUACUAUAGGCAGUUGGACAAAGAUGUAAAUGCCUUGUUUACAAAUGCUACCCAGAUCUCCUAAUUAGGACCACACAUGCGGAGAACCCAACAGCUUUUGGACUUAUCGGCCAAUGGUCUUCUUGGGAAGGUCUCUCCUAGUCAUGGGAAUUGUCUUUUUAUUGUUCAAGCUUUUGCAUAGACCUGGAAGAGGCAUCCAUUGCUGUUACCCCUGAGUUUAUAAUCAUGCUGCAAGUCCAGUGGGGAACUUUGGCACAAAGCAUUGAAUGAGAUGGGACUGCACUUAUGUAGCCUGCAUUUCUUGAGAAUAAAGAUUUCUGUUCAUUUAGUGCAGUGGUUAUCAUCUGGGGGAAAACCAGUGAGUAGAGGCCAGGGAUGCCACUAAAAUCCCUACACUGUGCAGGAAAGCUGUCAGCCCUUUGUCCCACAAGAGAUUAACUGGUUCCAAAAGUCAGUAGUGCUGUGGUUGAGAAACCCUGUUUACCACCUGUAGGUUCCAGAGAGCUCGGAUGGUGGUGGUCAUUGUGCUAAGUUUCAAAUUCAGUAUUUAGGUUUGGUUUUUAGCUUAUAGGCAACAAAUUGGCUGACUAUGGGGUGAAAAGGAAGCACCUCCUUUAUCAAGAUUGGCUUCAAAAGAUGUCUGCCUCCCCUUCUGGUGGGUCCUGUGUCCAUUCACAGUGUGAGAAAUGGAAAGGAGGUCACUAAGAGACUUGCAAUGGAUGUAAUAACUGGAUGCAGAAACUCUGGAUCUGAAGGGAAUGUUCAUGACUAUUUCAUCCCUCCUGCUGCCUUGGAGAACCAAACGCAGGAGCCACCCAAGGUGAAAACCAUCCAUUUCUUGGAGAAGUGCCACGGUGGGGUUGCAAGUCCCAGGAUCAAGUUUUCGAUGUGUCUCUUUUUCCCGUAAAGUGGCUGAAAUCUGAAGCUGAAUCUGCAAGUGUCAUGGAGUCAUUGAAUCUCACAGUCUCAACUGAUAAAAGUUAUUAAAGGUCGUCUGGUUCAGCCUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-958.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1019.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 620.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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