Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-10:43

Sequence Length

650 nt

GC Content

0.4831

GCUCAUUCAAUGUCUGGAGCAAGCUUUCUGCACUCCACUGCCGGUGCUUUCUGGCUUCAAAAGCAGCUUCGAGACUGAGGAAUAGUAGACAGGAUUAGAAUAAGGCCCGGGAGUUCUACAACUCUGCUGAAUUCAAAAGGACCAUGAUCUUGGUCAGCUAAACCACACCCGAUGGCCAAGGGGCAGAGGAAAAGAUGGCAGAGUAGAGACUCUUGGACUUACUCAUUUGGAUUUUGGAGUUUUACCUGACUUGGUCAAGCCUCAUGCCAGAUCCAGAUUGUGCCUGCUUCCCUUUCACCUUCCAUCAUGAUUGUAAGUUUCCUGAGGCCUCCCCAGCCAGGAUUCCUGUACAGCCUGUGGAACCAUGAGCCAGGUAAAAAUGGUGCUACCCUUGGAAAUCCAAGAGCAGCUUCAAGAGUCAACUAUACCAGCAAUCCCUAAAGCUGGAGAAUUUAUGCCCAUGGAAAAGUCUGUAGCGUUUUGCAAACUGUGAGGCUGAGGAAUAGACCUAGUUCCUGCAGCAGAUCAAAAUGAAAGAUGCAGAAAUGCAGCAACUAUUGCAGGGAUUCCGUGAGACCAAGGACCUGUCUCCAUAGCAGGGCUGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGGGUUGGUCUUGCUGUCUCAAGAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-196 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -208.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 202.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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