Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A11-10:46
Sequence Length
635 nt
GC Content
0.4850
GGAGCAAGCUUUCUGCACUCCACUGCCGGUGCUUUCUGGCUUCAAAAGCAGCUUCGAGACUGAGGAAUAGUAGACAGGAUUAGAAUAAGGCCCGGGAGUUCUACAACUCUGCUGAAUUCAAAAGGACCAUGAUCUUGGUCAGCUAAACCACACCCGAUGGCCAAGGGGCAGAGGAAAAGAUGGCAGAGUAGAGACUCUUGGACUUACUCAUUUGGAUUUUGGAGUUUUACCUGACUUGGUCAAGCCUCAUGCCAGAUCCAGAUUGUGCCUGCUUCCCUUUCACCUUCCAUCAUGAUUGUAAGUUUCCUGAGGCCUCCCCAGCCAGGAUUCCUGUACAGCCUGUGGAACCAUGAGCCAGGUAAAAAUGGUGCUACCCUUGGAAAUCCAAGAGCAGCUUCAAGAGUCAACUAUACCAGCAAUCCCUAAAGCUGGAGAAUUUAUGCCCAUGGAAAAGUCUGUAGCGUUUUGCAAACUGUGAGGCUGAGGAAUAGACCUAGUUCCUGCAGCAGAUCAAAAUGAAAGAUGCAGAAAUGCAGCAACUAUUGCAGGGAUUCCGUGAGACCAAGGACCUGUCUCCAUAGCAGGGCUGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGGGUUGGUCUUGCUGUCUCAAGAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -204.1
Frequency: 0.0000
Diversity: 150.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((.....)).))))...(((((......))))).......(((((...(((((((((((..(((((.((.((((.((.((((..((((((((.((.(.((((((((...........(((((......))))).............((..((.((...)).))..)).......)))))))).))))))))))).)))).))...((((((((((.((((.(((......))).)))).)))....))))))))))).)).))))))))......((((((.((............(((((....(((((.(((((.((.((((............))))))..(((.(((((.....(((((((.(.(((((....))))).).))).................(((((..........)))))............(((((((...(((((((.((((((((..((((...((((((((((.......)))))).))))..(((.........)))))))...))))).)))..)))))))..)))))))..))))...))))).)))........))))).)))))...))))))))))))).)))))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((.....)).))))...(((((......))))).,,...,(((((...(((((((((({..(((((.((.((({.((.((((..(((((((((((.{.((((((((,..........(((((......))))).............((..((.((...)).))..))......,)))))))),))))))))))).)))).)).,,((((((({((,((((.(((......))).)))).}},..,,))))))))))).)).)))))}})},,...((((((.{(............(((((....(((((.(((((.(({((((({{,,,,{((({{{..,{{{(,{{{{,{{.....||||(((.{.(((((....))))).),)}).,,...,,.........(((((..........))))).....,,,,},||||||,..{{({((({({{{{({{{{..||,{,|.((((((((((.......)))))).))))...||}...,,...,.)))|,...)))}),}})}.,)))))))})))}||({{{|,,...,,}})}))),...,,..))))).)))))...)))))),)))))).,}))))))))))},,...,},..
Back