Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-1:18

Sequence Length

520 nt

GC Content

0.5596

CGGGCUCCAUCUCCAGGCCUCCCACUUCACCCUGGGACAUUAUGGUCGCUGGUCAGACCUCAUGACUCACUUGGACUCUUGAGCCACCUCUGGGGGUGGAGUCUCUCUCCUGGCAUCUGGACCCUUGGUGCUAUCGACGAAGCUUGGCUGGCGCUCUUAGCUGCUAUGUGCAAGACGUGUGUCCCAGGGAAAGCCCCUCUCUCUCUGCAGAGGUCAAGUGAAAGCCACGGCCGCAGCCAACAGAGUUCAAAAUGCAGGCUUGGAAAGUCCAGGGGGCUCUGUGGAGGAGAUUAGUCCUGAGAGACUGACACCAGAGCCACCUGACGAAUGUGGGUGCUCAGAGCCUUGGACUCGAUGACCUACCUCUCCUGCCUCCCACCUGACUCCUGAAGUAGGGGAGUGUAUUAACAGUCACAGGCCUCAGUUUACCUGCUUUCAGCCUCUGCCCUUCCCGAGAGGGUUGAAGCUGACUUGCUGCAUCGCAGUUUUGUCCUUUAGUUCAUCAGCUCUGGAACUUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-181.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -190.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 180.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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