Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-1:3

Sequence Length

1747 nt

GC Content

0.5695

AGGGCGCGCAGGCGGCGCGGGUGCGCGGUGCGGCGCUGGUAUCCAGAGGACGCGGUCACCGCCUCUGGCAUUUGUCGUUCUGCGCUUCUCCGCAAGGACCCUCUGUUAGGCAGGCGCCCACCGUAAGCCUCCCGGGCCUUGUGAACCUGCAAACCCAAGUCUGAGAGACGAUCCGCCUUCAGCGCUUUCCAGCUUGGCAGAGAGGCUUUCCCGGCGGGGAUCUUUGGUUGGCGCUGGCGAUGCGCGGGGAAGAAAGGCGAGGAGCGGCGUCCAGGCUGGGUGAUGUCCCAGCACGAGUAGGCGGGAUGCGCUCGCUUGGUCCUCCGGGCGCCCGGUCCCUGCCCGCGUCGCGCGCCCACCCCUGGGGACGAGAAGGCGGCCGCCUGAGGACCCCCGCCCGCGACCUCCGCGAGUCUGGAGCGCAGAGGACAGGGUCUGGCUGCUCUUUGGCCUUGGAUGGAAAGUGGGGAAUUGGGUGGGGGGCUGCGGACCCCUUAACGUGGAUUACUUGGUGUGUAUCAGCUGGGCUCAGAAGACCCACGACCUCUUCUCCAUCCGUGGAUUGAUUUGUUCUGCUUAACAGCUGGGUCGCCAAGCUGGAGGUAUUUUUCCCUCUCCACCCUGGUCUUCUCCUGUAACGUGUGGCCGCCUUUUCCAGCACGGCCUCCUGCCUUCCUGGUGCACUUUUUGGAGAACGUGGUGGAAUCAGAGGUUUCUGGCUGACUCGGUGGGUGCUUUGAACCAGGAAAGGACAAGAAAGAGGCUGGAGUGCAGUGGCGUGAUCAUGGCUCACUGCAGCCUCAACUUCUUGGCCUCUAGCGAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUCAGUAGCUGGGACUACAGGCAGGUGCCACUACACCUGGCUAAUUAAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUACAGACCAGAUUUCGCCAUAUUGCUCAGGAUGGUCUUGAACUCCUGGGCUCAAGUGAUCCGCCUGCCUUGGCCUCCCAGAAUGCCAGGAUUACAGAUGUGAGCCACUGUGCCUGGCCUGAAGUCUAGUAAUUUUUAAAACUUUGCAUGUUAUUCUGCUCAUGAGCCAAGUUCGGGUGCCUGUGGAACAGCUAUAUUCCUCAAACUAGAUAUGCACCCCAGUCCCUGGGGAUUCUGUCAAAAGGCAGAUUCACAUUCAGCAGGUCUAGGGUGGGGGGCCUGACAUUCGGCACGUCUCACAAGCUCCCAGGCGAUGCUGAUGGUGCUGGUCCCUGGACGCCCUCUUGAGUAGUAAGGAACAAAAGGACUCUCCCCUGUUCUUUUCAGCUACGUAGCCCAGUGGUUCUCCACUUAGGCUUCACACUGGAAUCAUCCAGGGAGUUUUAAACUAUAGUGAUGCCUGGCGGUGUCUUACUCGCAGAGCUUCUGGUUUGAUUGGUCUAGGUUGCAGCCUGGGCAAGGAGAUUUAAAAACUUCUCAGAUGGGCCAGGCAUGGUGGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCAGAGGUGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAGCACGGCGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGCGUGUGCCUGUGGUCCCAGCUGCUCGGGAGGCUGAGGCAGAAGAAUGGCCUGAACCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGACAGCCGAUCGUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-850.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -875.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 420.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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