Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A11-1:39
Sequence Length
2511 nt
GC Content
0.5293
CGCGCAGGCGGCGCGGGUGCGCGGUGCGGCGCUGGUAUCCAGAGGACGCGGUCACCGCCUCUGGCAUUUGUCGUUCUGCGCUUCUCCGCAAGGACCCUCUGUUAGGCAGGCGCCCACCGUAAGCCUCCCGGGCCUUGUGAACCUGCAAACCCAAGUCUGAGAGACGAUCCGCCUUCAGCGCUUUCCAGCUUGGCAGAGAGGCUUUCCCGGCGGGGAUCUUUGGUUGGCGCUGGCGAUGCGCGGGGAAGAAAGGCGAGGAGCGGCGUCCAGGCUGGGUGAUGUCCCAGCACGAGUAGGCGGGAUGCGCUCGCUUGGUCCUCCGGGCGCCCGGUCCCUGCCCGCGUCGCGCGCCCACCCCUGGGGACGAGAAGGCGGCCGCCUGAGGACCCCCGCCCGCGACCUCCGCGAGUCUGGAGCGCAGAGGACAGGGUCUGGCUGCUCUUUGGCCUUGGAUGGAAAGUGGGGAAUUGGGUGGGGGGCUGCGGACCCCUUAACGUGGAUUACUUGGUGUGUAUCAGCUGGGCUCAGAAGACCCACGACCUCUUCUCCAUCCGUGGAUUGAUUUGUUCUGCUUAACAGCUGGGUCGCCAAGCUGGAGGUAUUUUUCCCUCUCCACCCUGGUCUUCUCCUGUAACGUGUGGCCGCCUUUUCCAGCACGGCCUCCUGCCUUCCUGGUGCACUUUUUGGAGAACGUGGUGGAAUCAGAGGUUUCUGGCUGACUCGGUGGGUGCUUUGAACCAGGAAAGGACAAGAAAGAGGUGCCACCUCCUGAGUCCUGGUUCCUGCGGCUCCGUCGAAUCUGCAGUGAAGGCCUUUGGGAAGCGUGGGUUAUGUGGGUCCAGGGGUCCCAUCCUCCCGUGGAGGCCCUUGACCUGAGGAUCACUAACUCACACCCCACCGACUUCCGGCCCCCAACAAGGGCAGUGUUCCUCUUGCUCCAUUCUGCUCUGAAGUCCCCCAAACCGCUUCCUGGGGCUGCUUAGUGAAAUACAAGGCUCAUCUCUGAGGACCUCUACAGGGCUGGAUGGGAAGGACUGAUCCACAUUCCCACCAGGAAGUUUAGCAGAACCCCCGCGUGCCACCUGGACCCCUUGGAAGGACCUGGCUCAGGCUGGACCACCUCUUGAGAGGCAGGAGCUCUGGAUUUGAUCAAGAAUUCUUUGCUGAGCAUGGUGCCUCAUGCCUAUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGUGUGGGAGGAUCUCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGGCAACACAGAGAGACCCCAUCUCUAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUAAAAAAUUAGCAGGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAAGAGGAUGGCUGGAGCCUGGGAUGUUGAGGCUGCAAUGAACUGUGAUUACCCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAAAAGAGCGAGAGACCCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUCUUAUUUUGGAGAAUAAAGAGACCUCUGGAUUUGAGGUGCCAUUUGGGUAGAAAGAAAAGACGUUUACACCGAGAAAUAGUCUGUGUUGCCCUGAAGGAGCAGAGGGAUGCAUCGCUGGAGGUGACCUACAGUUGAAGAAGACUCAUUAUGACAGACCUUGUCCUUCUUCCUUGUGGAAAGUGUUUCCUCUGCUGCUACUGCUCAUGAGACUCUUCCCCCUCCCUGUCCCAGGGAACCAAAGGGCUUUCUACCACACCCUUUCUUGCCCCCCGCCUCCCAUGUCUGCUGUGCCUUUGUACUCAGCAAUUCUUGUUUGCUCCAUUAUCUUCCAGCCGGAUACAGAGUGAAUAGUUAACCACACUUAGGUCAAAUAGGAUCUAAAUUUUUGUUCCUGCUCCGUGUAAAGAGGCCAGUGUUUGUGUGUUGCAAGCAGCCUUGGAAUAGUAACUCUUCUCAUUUGUUUGGGAUCUGGCCACCAAGUUCCAGAAUGAUACACGGAUCAGUGCAGAAGUUCAUCAGGCUCUCGGACCUUAGGGCUGUUGGAGAAGGCUUCAGCAGCAGAACUGAUGGUGAAGGCUCGUGUUCUCCAUCCUCAACUUUCUUUGCUUCGAUCAUACACAAGAAUACAUUUGGAAGGGCAAAAAAUGAACACUGUCGUUCAUUGCAGCCGUGUUUUGUGACACAGAUGCACAGUCUGCUGUGAAGACCUUCUCUCAAGUGGCAUUUGGGAGUCCAUGCCAGAUCAUGGUGCUUCAUGAGAGACUGACAGCUAUCAGGGGUUGUGGCACUUAGUGAGGACUCUCCUCCCCCAGUGUGUGCUGAUGACACAUACACACCUGACAAUAGCUUGAGUCUUCUCUGUUCCUUUUACUCUGUAGCCAACAUACACAUGAUUUAAAACCCUUUCUAAAUAUCUAUCAUGGUUCAUCCUUGUCCAAAUGCAGAGUCAGAGCUAUUUGUACUUCAUUAUUAUUUCCAAGGCGAAUAGUUGGCUUUCUUUUUGCAAAAAUAAUUAAAGUUUUUGUAUGUUG

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-926.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -972.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 682.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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