Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A11-1:40
Sequence Length
2149 nt
GC Content
0.5202
CGCGCAGGCGGCGCGGGUGCGCGGUGCGGCGCUGGUAUCCAGAGGACGCGGUCACCGCCUCUGGCAUUUGUCGUUCUGCGCUUCUCCGCAAGGACCCUCUGUUAGGCAGGCGCCCACCGUAAGCCUCCCGGGCCUUGUGAACCUGCAAACCCAAGUCUGAGAGACGAUCCGCCUUCAGCGCUUUCCAGCUUGGCAGAGAGGCUUUCCCGGCGGGGAUCUUUGGUUGGCGCUGGCGAUGCGCGGGGAAGAAAGGCGAGGAGCGGCGUCCAGGCUGGGUGAUGUCCCAGCACGAGUAGGCGGGAUGCGCUCGCUUGGUCCUCCGGGCGCCCGGUCCCUGCCCGCGUCGCGCGCCCACCCCUGGGGACGAGAAGGCGGCCGCCUGAGGACCCCCGCCCGCGACCUCCGCGAGUCUGGAGCGCAGAGGACAGGGUCUGGCUGCUCUUUGGCCUUGGAUGGAAAGUGGGGAAUUGGGUGGGGGGCUGCGGACCCCUUAACGUGGAUUACUUGGUGUGUAUCAGCUGGGCUCAGAAGACCCACGACCUCUUCUCCAUCCGUGGAUUGAUUUGUUCUGCUUAACAGCUGGGUCGCCAAGCUGGAGGUGGAAUCAGAGGUUUCUGGCUGACUCGGUGGGUGCUUUGAACCAGGAAAGGACAAGAAAGAGGAUGGGAAGGACUGAUCCACAUUCCCACCAGGAAGUUUAGCAGAACCCCCGCGUGCCACCUGGACCCCUUGGAAGGACCUGGCUCAGGCUGGACCACCUCUUGAGAGGCAGGAGCUCUGGAUUUGAUCAAGAAUUCUUUGCUGAGCAUGGUGCCUCAUGCCUAUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGUGUGGGAGGAUCUCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGGCAACACAGAGAGACCCCAUCUCUAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUAAAAAAUUAGCAGGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAAGAGGAUGGCUGGAGCCUGGGAUGUUGAGGCUGCAAUGAACUGUGAUUACCCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAAAAGAGCGAGAGACCCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUCUUAUUUUGGAGAAUAAAGAGACCUCUGGAUUUGAGGUGCCAUUUGGGUAGAAAGAAAAGACGUUUACACCGAGAAAUAGUCUGUGUUGCCCUGAAGGAGCAGAGGGAUGCAUCGCUGGAGGUGACCUACAGUUGAAGAAGACUCAUUAUGACAGACCUUGUCCUUCUUCCUUGUGGAAAGUGUUUCCUCUGCUGCUACUGCUCAUGAGACUCUUCCCCCUCCCUGUCCCAGGGAACCAAAGGGCUUUCUACCACACCCUUUCUUGCCCCCCGCCUCCCAUGUCUGCUGUGCCUUUGUACUCAGCAAUUCUUGUUUGCUCCAUUAUCUUCCAGCCGGAUACAGAGUGAAUAGUUAACCACACUUAGGUCAAAUAGGAUCUAAAUUUUUGUUCCUGCUCCGUGUAAAGAGGCCAGUGUUUGUGUGUUGCAAGCAGCCUUGGAAUAGUAACUCUUCUCAUUUGUUUGGGAUCUGGCCACCAAGUUCCAGAAUGAUACACGGAUCAGUGCAGAAGUUCAUCAGGCUCUCGGACCUUAGGGCUGUUGGAGAAGGCUUCAGCAGCAGAACUGAUGGUGAAGGCUCGUGUUCUCCAUCCUCAACUUUCUUUGCUUCGAUCAUACACAAGAAUACAUUUGGAAGGGCAAAAAAUGAACACUGUCGUUCAUUGCAGCCGUGUUUUGUGACACAGAUGCACAGUCUGCUGUGAAGACCUUCUCUCAAGUGGCAUUUGGGAGUCCAUGCCAGAUCAUGGUGCUUCAUGAGAGACUGACAGCUAUCAGGGGUUGUGGCACUUAGUGAGGACUCUCCUCCCCCAGUGUGUGCUGAUGACACAUACACACCUGACAAUAGCUUGAGUCUUCUCUGUUCCUUUUACUCUGUAGCCAACAUACACAUGAUUUAAAACCCUUUCUAAAUAUCUAUCAUGGUUCAUCCUUGUCCAAAUGCAGAGUCAGAGCUAUUUGUACUUCAUUAUUAUUUCCAAGGCGAAUAGUUGGCUUUCUUUUUGCAAAAAUAAUUAAAGUUUUUGUAUGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-778.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -819.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 620.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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