Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-1:45

Sequence Length

2112 nt

GC Content

0.5123

AGGGCGCGCAGGCGGCGCGGGUGCGCGGUGCGGCGCUGGUAUCCAGAGGACGCGGUCACCGCCUCUGGCAUUUGUCGUUCUGCGCUUCUCCGCAAGGACCCUCUGUUAGGCAGGCGCCCACCGUAAGCCUCCCGGGCCUUGUGAACCUGCAAACCCAAGUCUGAGAGACGAUCCGCCUUCAGCGCUUUCCAGCUUGGCAGAGAGGCUUUCCCGGCGGGGAUCUUUGGUUGGCGCUGGCGAUGCGCGGGGAAGAAAGGCGGCCGCCUGAGGACCCCCGCCCGCGACCUCCGCGAGUCUGGAGCGCAGAGGACAGGGUCUGGCUGCUCUUUGGCCUUGGAUGGAAAGUGGGGAAUUGGGUGGGGGGCUGCGGACCCCUUAACGUGGAUUACUUGGUGUGUAUCAGCUGGGCUCAGAAGACCCACGACCUCUUCUCCAUCCGUGGAUUGAUUUGUUCUGCUUAACAGCUGGGUCGCCAAGCUGGAGGUAUUUUUCCCUCUCCACCCUGGUCUUCUCCUGUAACGUGUGGCCGCCUUUUCCAGCACGGCCUCCUGCCUUCCUGGUGCACUUUUUGGAGAACGUGGUGGAAUCAGAGGUUUCUGGCUGACUCGGUGGGUGCUUUGAACCAGGAAAGGACAAGAAAGAGGAUGGGAAGGACUGAUCCACAUUCCCACCAGGAAGUUUAGCAGAACCCCCGCGUGCCACCUGGACCCCUUGGAAGGACCUGGCUCAGGCUGGACCACCUCUUGAGAGGCAGGAGCUCUGGAUUUGAUCAAGAAUUCUUUGCUGAGCAUGGUGCCUCAUGCCUAUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGUGUGGGAGGAUCUCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGGCAACACAGAGAGACCCCAUCUCUAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUAAAAAAUUAGCAGGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAAGAGGAUGGCUGGAGCCUGGGAUGUUGAGGCUGCAAUGAACUGUGAUUACCCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAAAAGAGCGAGAGACCCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUCUUAUUUUGGAGAAUAAAGAGACCUCUGGAUUUGAGGUGCCAUUUGGGUAGAAAGAAAAGACGUUUACACCGAGAAAUAGUCUGUGUUGCCCUGAAGGAGCAGAGGGAUGCAUCGCUGGAGGUGACCUACAGUUGAAGAAGACUCAUUAUGACAGACCUUGUCCUUCUUCCUUGUGGAAAGUGUUUCCUCUGCUGCUACUGCUCAUGAGACUCUUCCCCCUCCCUGUCCCAGGGAACCAAAGGGCUUUCUACCACACCCUUUCUUGCCCCCCGCCUCCCAUGUCUGCUGUGCCUUUGUACUCAGCAAUUCUUGUUUGCUCCAUUAUCUUCCAGCCGGAUACAGAGUGAAUAGUUAACCACACUUAGGUCAAAUAGGAUCUAAAUUUUUGUUCCUGCUCCGUGUAAAGAGGCCAGUGUUUGUGUGUUGCAAGCAGCCUUGGAAUAGUAACUCUUCUCAUUUGUUUGGGAUCUGGCCACCAAGUUCCAGAAUGAUACACGGAUCAGUGCAGAAGUUCAUCAGGCUCUCGGACCUUAGGGCUGUUGGAGAAGGCUUCAGCAGCAGAACUGAUGGUGAAGGCUCGUGUUCUCCAUCCUCAACUUUCUUUGCUUCGAUCAUACACAAGAAUACAUUUGGAAGGGCAAAAAAUGAACACUGUCGUUCAUUGCAGCCGUGUUUUGUGACACAGAUGCACAGUCUGCUGUGAAGACCUUCUCUCAAGUGGCAUUUGGGAGUCCAUGCCAGAUCAUGGUGCUUCAUGAGAGACUGACAGCUAUCAGGGGUUGUGGCACUUAGUGAGGACUCUCCUCCCCCAGUGUGUGCUGAUGACACAUACACACCUGACAAUAGCUUGAGUCUUCUCUGUUCCUUUUACUCUGUAGCCAACAUACACAUGAUUUAAAACCCUUUCUAAAUAUCUAUCAUGGUUCAUCCUUGUCCAAAUGCAGAGUCAGAGCUAUUUGUACUUCAUUAUUAUUUCCAAGGCGAAUAGUUGGCUUUCUUUUUGCAAAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-751.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -792.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 425.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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