Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-1:48

Sequence Length

807 nt

GC Content

0.5031

GGCUGGCGCUCUUAGCUGCUAUGUGCAAGACGUGUGUCCCAGGGAAAGCCCCUCUCUCUCUGCAGAGGUCAAGUGAAAGCCACGGCCGCAGCCAACAGAGUUCAAAAUGCAGGCUUGGAAAGUCCAGGGGGCUCUGUGGAGGAUGGGAAGGACUGAUCCACAUUCCCACCAGGAAGUUUAGCAGAACCCCCGCGUGCCACCUGGACCCCUUGGAAGGACCUGGCUCAGGCUGGACCACCUCUUGAGAGGCAGGAGCUCUGGAUUUGAUCAAGAAUUCUUUGCUGAGCAUGGUGCCUCAUGCCUAUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGUGUGGGAGGAUCUCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGGCAACACAGAGAGACCCCAUCUCUAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUAAAAAAUUAGCAGGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAAGAGGAUGGCUGGAGCCUGGGAUGUUGAGGCUGCAAUGAACUGUGAUUACCCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAAAAGAGCGAGAGACCCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUCUUAUUUUGGAGAAUAAAGAGACCUCUGGAUUUGAGGUGCCAUUUGGGUAGAAAGAAAAGACGUUUACACCGAGAAAUAGUCUGUGUUGCCCUGAAGGAGCAGAGGGAUGCAUCGCUGGAGGUGACCUACAGUUGAAGAAGACUCAUUAUGACAGACCUUGUCCUUCUUCCUUGUGGAAAGUGUUUCCUCUGCUGCUACUGCUCAUGAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-272.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -288.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 196.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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