Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A11-1:7

Sequence Length

1956 nt

GC Content

0.4959

GGCGCGCAGGCGGCGCGGGUGCGCGGUGCGGCGCUGGUAUCCAGAGGACGCGGUCACCGCCUCUGGCAUUUGUCGUUCUGCGCUUCUCCGCAAGGACCCUCUGUUAGGCAGGCGCCCACCGUAAGCCUCCCGGGCCUUGUGAACCUGCUCUUUGGCCUUGGAUGGAAAGUGGGGAAUUGGGUGGGGGGCUGCGGACCCCUUAACGUGGAUUACUUGGUGUGUAUCAGCUGGGCUCAGAAGACCCACGACCUCUUCUCCAUCCGUGGAUUGAUUUGUUCUGCUUAACAGCUGGGUCGCCAAGCUGGAGGUAUUUUUCCCUCUCCACCCUGGUCUUCUCCUGUAACGUGUGGCCGCCUUUUCCAGCACGGCCUCCUGCCUUCCUGGUGCACUUUUUGGAGAACGUGGUGGAAUCAGAGGUUUCUGGCUGACUCGGUGGGUGCUUUGAACCAGGAAAGGACAAGAAAGAGGAUGGGAAGGACUGAUCCACAUUCCCACCAGGAAGUUUAGCAGAACCCCCGCGUGCCACCUGGACCCCUUGGAAGGACCUGGCUCAGGCUGGACCACCUCUUGAGAGGCAGGAGCUCUGGAUUUGAUCAAGAAUUCUUUGCUGAGCAUGGUGCCUCAUGCCUAUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGUGUGGGAGGAUCUCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGGCAACACAGAGAGACCCCAUCUCUAAAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUAAAAAAUUAGCAGGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACCCAGGAGGCUGAGGCAAGAGGAUGGCUGGAGCCUGGGAUGUUGAGGCUGCAAUGAACUGUGAUUACCCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAAAAGAGCGAGAGACCCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUCUUAUUUUGGAGAAUAAAGAGACCUCUGGAUUUGAGGUGCCAUUUGGGUAGAAAGAAAAGACGUUUACACCGAGAAAUAGUCUGUGUUGCCCUGAAGGAGCAGAGGGAUGCAUCGCUGGAGGUGACCUACAGUUGAAGAAGACUCAUUAUGACAGACCUUGUCCUUCUUCCUUGUGGAAAGUGUUUCCUCUGCUGCUACUGCUCAUGAGACUCUUCCCCCUCCCUGUCCCAGGGAACCAAAGGGCUUUCUACCACACCCUUUCUUGCCCCCCGCCUCCCAUGUCUGCUGUGCCUUUGUACUCAGCAAUUCUUGUUUGCUCCAUUAUCUUCCAGCCGGAUACAGAGUGAAUAGUUAACCACACUUAGGUCAAAUAGGAUCUAAAUUUUUGUUCCUGCUCCGUGUAAAGAGGCCAGUGUUUGUGUGUUGCAAGCAGCCUUGGAAUAGUAACUCUUCUCAUUUGUUUGGGAUCUGGCCACCAAGUUCCAGAAUGAUACACGGAUCAGUGCAGAAGUUCAUCAGGCUCUCGGACCUUAGGGCUGUUGGAGAAGGCUUCAGCAGCAGAACUGAUGGUGAAGGCUCGUGUUCUCCAUCCUCAACUUUCUUUGCUUCGAUCAUACACAAGAAUACAUUUGGAAGGGCAAAAAAUGAACACUGUCGUUCAUUGCAGCCGUGUUUUGUGACACAGAUGCACAGUCUGCUGUGAAGACCUUCUCUCAAGUGGCAUUUGGGAGUCCAUGCCAGAUCAUGGUGCUUCAUGAGAGACUGACAGCUAUCAGGGGUUGUGGCACUUAGUGAGGACUCUCCUCCCCCAGUGUGUGCUGAUGACACAUACACACCUGACAAUAGCUUGAGUCUUCUCUGUUCCUUUUACUCUGUAGCCAACAUACACAUGAUUUAAAACCCUUUCUAAAUAUCUAUCAUGGUUCAUCCUUGUCCAAAUGCAGAGUCAGAGCUAUUUGUACUUCAUUAUUAUUUCCAAGGCGAAUAGUUGGCUUUCUUUUUGCAAAAAUAAUUAAAGUUUUUGUAUGUUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-668.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -706.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 530.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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