Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SLC39A6-1:2

Sequence Length

971 nt

GC Content

0.4974

CCGACCGGACUUUCACUUCUGGCCAGCCCUUUCCCCACCUGGGCGCGGGAGCGGGUGCCAGUCUUUAAACAACCUCUCGAUGGGUCCCACGAAGAUGUUUCCAGACCCUUGGAAUGCCAAGUUCAAGUUUAGCUAUGUCUCGCGGAGAGGCCGGUGGAAGAAGCAACGAGAAUGAAGCACCCCAGUUCUCUGCUGAGCACAUGGGCAUCUGCAAUAAAGAUUUAAUUUCCCAGCUUCUCCUGAAGCUCGGUAUGGCCACAACACUAAAUUCUGCCCGAGGAGAUUAAGCAAAAUAGUAUGGGACUUCCAAGAAAUGUUUUUAAAGUCAGGGGCAGGCCUUUCUUCAUGCCUUCUUCCUCUUUGCUGGCUGGAACGCAAAGACCAUGGCAGGAGGCCAAGCAGCCAUCCUGGAAGGUGAAAGCCUCAUACUAAGGACGUCAGACAGCGAAAUAAGAGCCUGGGUCCUUGACCCUGUAGACAUCUCCCUCCCCAUCCUGGUCUGUCUGCCUUGACUCCUUUCAUAUGAGAGAAAUAAACUUUUAACUUGCGUAAACCAGAAAGAAAAUUUUACAAUUUUUUUUCACACACAGUUGAAUGGAAGCCAGACUCAUACACUAAUCUCAUCUCCACUUUUAGAGAUGAGGGGAACAGCUUGCCCACAGUGACAGCCAGUGUGAGCUGGGUUUCUGUUGCCCAACUCAUUGGGGUUCCAACCCUCACCUAGACUGCCCUAUGAAAUACCUAGAACUUGGUCAGGAGAAAAGAUAAGAGGGGAAAAUGUCAGCAAAAGCCAAAGACUAAGGGUAGCAGGGGCAGAAGUGAGAGUGGGAAGUGAAAGGUGAUAUAAUUUCCCUAUUCCACUGAGCAGGAAGAGGCUGCCUUUGCAUCCCUCUGUGUCGGGAGACAGUCUGGGGACAGUCAGCAGGCACCUUGCUGCAGGAGAGCCCCUGCAAGAGCAGCCUUUGUGGAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-309.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -328.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 286.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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