Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SLC39A6-1:6
Sequence Length
4270 nt
GC Content
0.5527
CUCCAGCCUCCCAGUCUCUCGGAAUCCGCAGCCUAGGUGUGGCGCCCCGACCGGACUUUCACUUCUGGCCAGCCCUUUCCCCACCUGGGCGCGGGAGCGGGUGCCAGUCUUUAAACAACCUCUCGAUGGGUCCCACGAAGAUGUUUCCAGACCCUUGGAAUGCCAAGUUCAAGUUUAGCUAUGUCUCGCGGAGAGGCCGGUGGAAGAAGCAACGAGGUGAUCUUUCCUGCUUGGCAUCGGCAUCCUGGAACCCCGCGACCCUCCUCCUCGCAGGGGUCUCGGGACCCUCACCCUCUCAAGCGGGAACCGGCGUCUGGCGGGGGCGGGGGUGGGGGCGUUCUCGGGUUGCUGCUACCCAGCGGGGCGUGUGCUUGCCGUUUGUUAGAAUGCGGCUGACCAAAGGGUAGAAAAGGGGAAAGAUUAGGGAUCCACGAGGCUAAUAAAUUCUCAGUGGCUGCACACUUUCGGAACCGGGAAGCUCGGGGGCUUCCCCCGGAGCGGGCCCUGCAGCUGGGAUCCAAGUGAGCUGAGCUUCCCCGCCCUCCCAACCGCGUCCUGGGCCCUACUUCCUGCCCUUGCCUCCCCAACCCUGCAUCCCGCCCCGCACUUCCCGCACGUGGGUGUGGCCGGGCCCUCUCUAUUAAAGCAAGAGUGCCCUAGGACAAAGCCGCCCCUGUCCCGGACAGAGUGGAAUAAGAGCGCCUCCUUCAAUCCCCACUCGCGCCUGCACCCAGAGCACCUGGGACACAGCGGCUCUGUCUUGGAGAACAGGUGCCUCAAUAGGGAGGGCCUGGCCAAACCUAUGCGCGGGAAGUGCGGAGCGGGAUGCAGGGGUGGGGCGGCAGGUGCAGGUAGUAGAGCCCAGGCAUGCGGUUGGGGGGUGGGGGGAAAUCUCACGUGCGAUCCCAGGUGCGGAACCCGCUGCUGGGAAUGGGGUGGAAGCAAAACAGGUACUGCACGCACAGGCGAGGUGCCUCGUGGGGGAAUCGAAUGUCAGGGAUGGUGGACAGUGCGGAUGGGCGGCAGGUGCUGGGGCUCAGGGGAGAUAACUCAGAGGCAGGCUCGGUGGAGAACCCAAGGCCGGCGACCAGGUGCAGGCGGCCCACAGGCCCUGGAGGCAUACAGCGGGGGGACAAGGUGGGAAGGAGGCCUAUGCCCCAAGAGCUCAACCUGUGCUGCAUCCAGGCCAGCUGCCACCCAGGGUAUGGGCCGCAGAUGCCCUAGGAUCCUUGCUGAUGCAUGAUGCAUACCGGUGCCCAGCGUGAGAGCCAUGGGAAGGCAGCACGCAGCCCUGGCUCUCCCGCCCAGGCCCCUGAUACCAGGCCAGAGAAAGACCCGCCACUAAGAGCUCAUUUCCCCCUGGCCGGAGACCCAGGGGUCUGUGGACUGCAGCGCUAGGGUCCAUGCCCAGGUACCCAUAUUCCUCAGUGGCCUCUGCCCACUGACCACCCCCGCUCUCUCCCUCACUGCUGAAUGUCCAGGACCUUACUCGACAAACACCCAUAGUUGUUCGAGGAGGAGUUAAUGUACUGAUGGAUGGAUGCAGGCAUUUGCUCAUUGACAUCACUGCCCACCCCACCAUCUGCUUGCCUUCUGGCCAUGCUUCAAGCAGGCACUUUGGAUACUGGACUGUCUUCUGUGAAUGUGGCUUUGGGCAGCACUAAUAACAAGAGCUAGUUACAGGGCCUCACUGUGUGCCAGGCACUGCACUGUGUACACUCUUACCUGUCCUGGUCGUUCAAUGAUUAAAUAUGCAGAUCUAGGAGGUGGCUCUUACAGAUGGGGAAGCUGAGGCAGAGAGAGGCAGAAUAACUUGCACACGGGCACACAGCUAGAAGACAAGCUAGCACCUGGGAAGUCAGUCUCCAGAGCCCAGGCAGGGAAGUGUGUUUUGCUAACUCUCUGGUGUGAGCCACCGUGGUUCCCAGGGCCUCAGUUUCCCCAUCUAAGUUGAGAGGGGUGAGUUGGUCCUCCCAGCAGCUGUUCAGUGUGUCACUCCUCACCCAUCCUUUUAAAGCCCUGCUUCCUGGUGAGAGUCUCCCCUAGGCCAGGGUUUCCAGGCAUUCAUUUGCAUGAAUCCCCUAGAGAGCCUAUUCAAAGGCAGGUUCUGACUCUUUGAGGUUCUGUGUUUCUAAGUAGCCCAGGUGAUGCUGAUGCCCCAUUCACGAAUGGCACUCUGAGGAGGGAGGGCCUAGGUCAUUUCCCUGGAAAUGUAAGGAGAACCUCUCCUCAAGGAGUUCUACAGCCAACUAACAAACCACCAGUCCACAGGGGUGCUGCUUCAGACAAGCUCGCCUAGUGAUGGAUUGGAAUAGGCCAAGUCAGUGCAGAACUCCUGAAGGUUAUUAAAAAUCACGGAUCUACCAUUAAUCCAGAAAUACUUUAAAGCAGUUGGCUAUGCCCAUCUAGGGCACUGUGUGCUUGGGAGGGUGGAUGUGAAGAUAGCACCUACAGCUGAGUAGGAAAACAGCUCUUCCAACUCCCACUUGCAACCCUUUCUCACCUAAGAACUUGAAAAAUUAUGUGUCUAUGAGCCAGUUGGGCAGACAGGUGAGAUGCCCUCAAUUUUGUACUUUAAAUCUCUCCCCGUGUGAAUCUUAGUCCCUGGUGCACCUCACUGAGCCUGAUUCCUUACCUCCUGAUGAUGCUUCCCGAAAUCCCCUUGCUCCCAGGUUAACAACUCCCACCCCCAGUGUCUCCUAGCAAUGGGCUCCACUUGCAAGAAUCUCUACUAUAUACAAAGCAUUCAUUCAUGUAUUCAUUCAUUCAUUCAUUCAUUCACUCACUCAGCAGAAGAUGAAUGAGUGCUUGUCAGAGUUAGGCUUGGAGUUGGUGGUAGACAAACAAAGGAAAGGCAGGCUUUGGAACUAGAAAGUGCCCUAUGAGUGAUUUAGGUAGAACUAUCCAAUGGCCAUGACCAGACUGGAUGAGCCUGUGAGAAUUGGGAGCAGGAAAACCAGCUAUAACCUCUUGCAACUGUCCAGGCUUGAAACACUAGAAGAUUCACUUGAAAAUUACUAGUGCUUUUGGCAGGGGCAUUUAUUCAGUGUUCACUGGGCAGCUGUGCCCUGCUGCAAACAUGGUAGGCACUGAGAAGACAACAGUCAGCAAGGCAGUCUCUGUGCCUGAGAGGCUCCUGGGAUGAGGAAGGAGAUAGGUUCAUAGUCAGGUCACCCCUCCAGGCUGCAGAGCGCUAGAGAAAAGUCCUUCCCACAAAGGUCCAGGCUUGGGGUAAAGAGCCUCCCAGACCUGGGGCUGCUGGGAGACCUGCCCAGAGGGUCCUGGAGGAGGAGGUGGGGGAAGGAAGGCAGCAUUCCAUACUCAAAGGUCUAGAGCUGCAAAAAGGCUCAGAGAAUUCCAGAUGCAGGACUUUUAAUGAAGCUGGAGCACAGACUGCAGCUCUGUGGGGAUAAGUGUGAUGGGGAGUGAGAGAAGUAAGAGGGGUCAGACUUUCUGGUACAGAGGAGAAAGCUGGCCUUGGUCUAAAAGGGACAUGAACACCCUAGAGUCUCCUCCUGAGAGUGGCUGGAUCGGGGUGUGCUUAGACCCCAGGCAGCAGUGGGGGAGGUGGGAGUGGGGAGGUUGCAGGCAGCCCUGCUGUCAGAGGCUGGGCAAAAGUCCUGGCGAAGAGCAGUGAGGGCCUGGUCUGAGGCCCAGAUCGUGCAGAAGUGAUGAAAUUCAGGGAUGAAUGGGACGAAGGACUGGCCCAAGGUGACUUGGUGCUGUCAGAUUGGGAGACUGAGUGGACAGAGGGAGUCUCAGGCAUAGGGAGACAAUAUGGAACUCGGUCAGGACAUCUCGGUGGAGAUUCAGGGCUCAAAAGGGACAGAGUGUCUGGGGUUGGAGACUUGAGUCAUGUGAGGGGCUUGUGGACAGGUCAUCUCAGGAGCUCUGAAGUGUUUAGGGAAAGAGGCCAGAACCCUGGGGACAGUGGCACUUAAAGGGUCUCUGUCUCAUGCCACAGGUGGGAAAGUUCAGUUAGAGAAGUGGGGACAGAGCCAGAAGAGAGCACCUUGGCAAUAUCUAAGGCCAUAAGGCCUAUUAGGACAAGGGUUAAACAAUUAGGACAGAUUGUUAAACUUGUUGGGUAGGUGGUAUGCAGUGGCCUAAGCAGGAACAGCUCUAUUAUCCAGGUGGGGAUGGCAGCUCCACUAUAGUGGUCAAGUCCUAAAUGGUGAGUAAGGGUAGAGGUUUUCCCACUGGUGAGCCCCCUGAAAACCUUGGCCUCCUAGUCUGGAAGAUAUUAGGUUGCUGCAAAAGUAAUUGCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1780.44 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1852.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 1032.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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