Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SNAPC3-11:6

Sequence Length

793 nt

GC Content

0.5725

AGUCAUAAAAGGAUACAUGCAGUAUGAUUUUAUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAUCUUAAAAAAGAGAAAUAAAUUUGAACAAAACUAAACUACAAGCCCGCAGUUCCCCGCCGAAAGCGAGGUGGGGGAGGAGGGGGCGGGAACGGUCGAGGCACUGAGAGUGGGGGAUGAGAAACGAACUCCGUCCCCUGCACAGUCAGUGCCUUCGGGGGCUCCACCACCGCGCGCUCCCACCCUCAAGGUUUGGACUCCUAGGGGAGGGAGAGGACGGGAGGGAGAGGAGGAUAGGUGGAGGGGGAAGAGGGACUCCUUUUCUCCUCCUGCCAGCGCCAGCUGGGGCAAACUUGAGCUGGCAAAGCGCGAGAAAACUUUUCUUUGGAAAGUUUAGGUAGCGCAGUUAGUGGCGGAGGCUCAGGGCAAGCUAACAGUGCUGGGGCGGGUGUGGAGGGAGUGAGCUGGGUGCGAUUGGGAGAGGGGAGAAGGGAGAAGGGAAGGAGUGGCCAGCUCCCUAGGCGGUUGAAGAUCCAAGUCUCUUCGGUCAGGUCCGCCCAAGGUCCCAGAGGCACUGGGGGGUCGGGUGACUGUGCGGAGUGUAAAAGACAUUUCCUUAGGAAACAGACAAGGCAGGGCCAGGAGUUCCGCGGUUUUUUUUCCGUGCAGAAAUCACUACCCGGCGACGGCUCAGGGCGGUAGAGGGCAAGUCUUAUCUGCCAAGGCGGGAUUAGAUUCUCUCGCCGAGGGUCCCAGUAUCCCGCCGCCCAGCAAGGGCCGAGCGCGCGCGCGCGCCAGGGAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-318.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -330.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 252.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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