Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-SRSF6-1:1

Sequence Length

805 nt

GC Content

0.4547

CAAGCAUCGUCUGCCCUGUGGGGGCGCAGCUCCUGGACUUUUUAAAAUUCCUGGAAUUGUGUCUCUCUAUCAUGGGGCUGGUACUAUUACCAUACGUUUCAGAAAACAGCAUCUGUUUACAAAGCGUUUUAUUAUACAACACAGAAAUACAUUUCACCCCAAAUGAUAACAGUGAACUUCAGCCCCCAGAAUCUCCUUCUCCCCUUCGUGAAACAGAGCUGGGAUGAUGGCAGAGGACUCCAGAACGCACUGAGAUUGUUCCUUGGCGUGACAAAUGGCAAAGGACUCUAGAACGCACAGAGAUUGUUCCUUGGUGUGACGGGCCAGACAGCACACCUUUCUUCAAGCCAUUCUCACAUCAAAUAAAACGUUGAUAAAUCAUUGUUUCUCUAAGCUUGAAAAAUGCUACUAACUCAAGACAAGGUGAAAGUGAGUUUGUUGAAAUCAACGUGAAGGAUCGAGGGUACCAACUUGGAAUGUAAAACCAUAGAAAAUACCAUCUGGGAACACGGAAAUCAUCUGUCUUAUCUGGAAGCCUGUCUCCAGAGUGGCAAACUUAGGGACUGGUUUGAGGACAGAGUGUGCCCUGUGUGCUGGGGAGGGGUGUAAAGGACUGGGAUGGAGGAGGGGGGGCUCCAGAUGUUCUUUUACCCAUAAAUACACUGUACAUCACCGUCUGCCACUGAAGCUUAAGGAUUGAAAACCUUGGGGAUGUUUCACUGGUUUUGCUUCCGCCUCUGCAAUGUUUGAACUUGCAUUUUCUGAGCCACGUAUGCAACUAAAAGCCUUACAUGCAUUACCCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-222.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -238.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 177.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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