Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-SRSF6-1:5
Sequence Length
3868 nt
GC Content
0.4723
ACACGCCCGCGGCUGGCACACGCGGGCUCCCCCGCGCACCCUCUCCGGGGCCGACCAGCUCGGGCCGCUGGCACAGUCACGCGCGUCCACACAUCACCCCCGCACCCACACGCCGGGCAGGGUCCUCGCCUCUUCGCCCCGCGCCGCGCCGCGCAGCCAAGCAUCGUCUGCCCUGUGGGGGCGCAGUUGGAUCUGCCUCCUGGGGAAGUAACAGCCGGGAUGCCCUUCCAGGUGACCUUCGUUUGGAGAUUGGGUGUGCUCCAGGCACCCCAGGUGAUUCUCAGGCACGCAAGAGUGUUUGAAUGGCUGAUGCAGUGUCAGGGACAAGGAAAGUUGAGAGCCUCCAGGCACAACUCCAGGGCUGCCAAGCCAGACAGACACCAAACUCAAACAAGCUUAAGUGAAAAGAGGAACGCAGUGGCUUACUUAGCUGAGCACUUCAUGAGCACCUUCAGGCAAAGCUGGAUCUAGGUACUCGAAUGAUGGCAUCGGGCCUCCUCUCUCUCCCUAUCUGUCUGUCUCUGUAUCUCAGCUGGGCUUCUCUCUAUGGGUAGUCAAAGAAACCGGCCAAUGACAGCUCCAUACACAGGUCUCACAGCUUACCACCUUCAGUAUAAAAUGAGACCUUCUGAACACCCCACCACACUGUCCACAAAAACCCAGUAAAGCUAUUUAUUGGGUGAUUUGGUUCACAUCCUAUUUCCUAAAUGAAUCAAUUUGGCCAGGGAUAUUGGCAAGGGGAAGGGGUGUCACCAUAAUUGCCCAGCCUAGGUCUUUUGUCCACCUCUCUGUAUUGAGGAUGACAGCCAUAAAUGACAGCUCCAUGAAGACUGAAUGGAGUGGGGAAGGGGAAUAUUCUCCAAAUAAUCUCGGGCAGUCUGGUGGCACUGGUCUAGCUCUCUUAAAAAUCCCUUAAAUAGGCUGGGCGCGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGAAGGCCGAGGUGGGUGGAUCAUGAGGUCAGGAGAUGGAGACCACGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAACUACAAAAAAACUUAGCCGGGCGGUGGCAGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGGUGAGGCCGGAGAAUGGCGUGAACCUGAGAGGUGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAUAAAUAAAUCCCUUAAAUAAGUGGUCUAGAGACUUAACCAGUCACCUGGGGCCUGCUCUUUCCAUAUGGCCUCGUCCUCUCCAUCUGAUGCUUGUUCUAACCCCCCAUACCCAGAUAGACCCUGUGAUUUUUGUUGUUGUUGAGACAGGGUCUGGCUCUGUCGCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUCUUGGCUCACUACAACCUCCUCCCCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCGUGCUUCAGUUUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGCUCCUGGACUUUUUAAAAUUCCUGGAAUUGUGUCUCUCUAUCAUGGGGCUGGUACUAUUACCAUACGUUUCAGAAAACAGCAUCUGUUUACAAAGCGUUUUAUUAUACAACACAGAAAUACAUUUCACCCCAAAUGAUAACAGUGAACUUCAGCCCCCAGAAUCUCCUUCUCCCCUUCGUGAAACAGAGCUGGGAUGAUGGCAGAGGACUCCAGAACGCACUGAGAUUGUUCCUUGGCGUGACAAAUGGCAAAGGACUCUAGAACGCACAGAGAUUGUUCCUUGGUGUGACGGGCCAGACAGCACACCUUUCUUCAAGCCAUUCUCACAUCAAAUAAAACGUUGAUAAAUCAUUGUUUCUCUAAGCUUGAAAAAUGCUACUAACUCAAGACAAGGUGAAAGUGAGUUUGUUGAAAUCAACGUGAAGGAUCGAGGGUACCAACUUGGAAUGUAAAACCAUAGAAAAUACCAUCUGGGAACACGGAAAUCAUCUGUCUUAUCUGGAAGCCUGUCUCCAGAGUGGCAAACUUAGGGACUGGUUUGAGGACAGAGUGUGCCCUGUGUGCUGGGGAGGGGUGUAAAGGACUGGGAUGGAGGAGGGGGGGCUCCAGAUGUUCUUUUACCCAUAAAUACACUGUACAUCACCGUCUGCCACUGAAGCUUAAGGAUUGAAAACCUUGGGGAUGUUUCACUGGUUUUGCUUCCGCCUCUGCAAUGUUUGAACUUGCAUUUUCUGAGCCACGUAUGCAACUAAAAGCCUUACAUGCAUUACCCACCCUUCACCUCUCUUACUAGUCCUAUUUACAGGUGAGAAAACUGAGGCACAAGGAGUUUUGCUGAUUCGGGAUUGUUACGGGUUUUAGGUUUUGUUUUCCUCCUGACAGCUCCUGGACUUUUUAAAAUUCCUGUAAUUGUGUCUCCCAAUCAUGGGCCAGGAAUAUGAGAAUCAGCUGUGAACUUCGAGCCUGUCCAUCUCAAAACUCUUCAUCUCCAAGACAUUUCAAUAGAGCUUUGCCAGUAAACAAAAAUAAAUACGGUUCGGUUUACCCAGAGGCCAAAUCCCUUGUAAUAAGUUCUGGGCCAGUUUCUUCCCAGAGCGGGAGAAUAUACAGUUGUAGUUUGAGUUGAUUUUAUUUCUUUGAGGCUUUGUUUUUCUAGUCUUUCAGGCCUUAACCUCACUCCCUCAGGAACAGCUGAAAUAUGAGAAGAGAUCAUAUGGCCCCCAAAAAGUCCCCAGAUUAACCAAGAUUGAUGCCACCCAGGGCCCAGUUGGGGUCAACACCCUGUGUCAGGUGCGCUCUCUGUAUAAUUCCUGUUUCCUGUGAGAAGAGCAUUAAAGGCCCGUUAAUGUUUUAAAAUGAAAUGCAACCUCUUAAUAAUCAGGUUUCUCCACUCUGCUAGGAUUCCAAAAAAAAAAAUCAGCAACUGACAAAUGUUAAAAAUUUCCUCGCUGCUAAUCAUGCUUUCCCCCGCUUCCCUUUCUUUCCCCCUCUCUUCUAACAUGAAUUUAUUUUCUAUUUGAAAGCCAAUCUCACUGGUUAUUAGAUAUUCUCCCUGCUGUCACUAUCAGUAAAUUAUUAAACAGCUGACCAAGCUUUGUUUUAAAAUGAUUCUCUUAUGAAGCUCAGUGAUAUAUUUGCUAUGAAUACUGAAUGGUGCCGCGGUCUCUAAGGUCACGUGAAUGAUUCCUAUUUACUACCUUUAGCAAAAUGUGUGUGCAAUUAGCGGCAAGAACUUGACUUGAAUCACAGUUACUAGGGAUGCCUGUAGCUCAUUUACAUGGAGCUCCCUUUACUCAUUACACUCCUGCCCAGGAGAAGCGUGUUAAGAUUCUAGGCCAGGUCACGAAAUAGCAUAUAGACUUGUCUUUUGUCAUUCCUCACCUCCUUUCUUGUCUUGCCACUGCUGAGCCUUGACAUACCUGUGGGAAUCCUUUGUUUCAUGGAGCAGCGGGUUCUAAGUGAAUUUUUGCUUAAAGAAAAUAAACGUGAUUGAGAGAAAAUUACUUACCUGUCUGUGUCUCUGCGUCUCAUCUAUAAAAUGGUCGUCAUAAUUUCUACCUCACGGAUUCUAUAAUGAGAACAAAGUGCUGAGCACAGUGCCUAGCAUCGGGUAAAUAUUUGGGAGGUGAUGGGUACUUAUUCUCCUGUUGACUGCUGCAUUAGUCCAAACUCUCAGUUGUAAGUGACAGAGACCUAUCUCCAAUUCACCUGAGCCAAAGAGGAAACACAGUGGCUUCCCUAAUCAAACAGUGGUUGAACAGUCAAGGUCUAACUUGGAAAACAGAAACUGCUUCAAGUAUUUGCAACAGAGGGGAUUUAAUGCAGGAAACUGGCUACACAGAUGAUGAGAGAGCUGGGAGACCAGGAAGGGAGAGGAAGGUAACGCACAAAUACACGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1271.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1345.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 1062.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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