Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-WDR26-1:13
Sequence Length
604 nt
GC Content
0.5381
AAACGCUGUAGCUCGCUCCACCUGCUGCUGCCGCUGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCUUUGCCACUGCGAGAACUGUAGCGGUGCGACCCGGGAUUCCCUCCUCUCGGCGCCCCACCCUCGACUCCUGUUCCGCUGAGCGCGCCCUCCCCGGCGGGCGGAGACUGCAGCGCCGGGGGCUGAGGAAAGCCAUCCGACCUUGGGACUAGGGAAACGUGGACUUGGUGGGCUAUUCUGCGCUGAAGAGGCAGCAACGAGGGCUCGGUGGUAUUGGUGUUGGUCCUAGUGGAAUUGUCAAGAGGAUGCUUUUGAAGACCUGAUGCCUGGAGGUACAGCAGCCAUCUUGUGACCAUAAGGAGGAAAUCAACGCAUUAAGAAGGGAAAAGCUAAGAAGAUACAGAGAGCAGGGACCACUGACAACAUGAUCAAGCCACUCUACCAGGCCUUAACUUCCUAUUCCCUGACUUCUUAUUGAAAGAGACAAUAAAACUUCUCAUUUGUUUUAACCCAUAGAAGUAAGGCAUUCUGUUACUUAUGGGUGAACACAAUUCUUAACUGAUGCCAUGGUUUAAUGGGAGUAGGGAUCCUGGUAUGACAGGAAAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-198.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.5
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........((((((((.....(((((((((((((((.(((((((((((..((((((((((((((..........)))))).)....(((...))).(((((((((((((((((.((.((((((((((((....((((((.((((((....)).))))...)).))))((((((((......)))).))))....)))))).))))....)).))...)))))).......)))))).)))))......))))))).)))))))...)))).))))...))))).....(((((((....)))))))..((((.........)))).))))))((.((((((....)))))).))((((((..((((((.(..(((((....(((((((...(((.(((.(((((....(((........))).(((.........)))......))))).))).))).)))))))......((((..........))))...(((((..(((((((..(((((.(.....).)))))))))))))))))...)))))..)))))))..))))))....))))).))).(((((......))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...........((((((((..,,((((((((((((((((.(((((((((((,,((((((({((((((..........)))))).,....(((...))).(((((((((((((((((.((.((((((((((((,.,.(({(((,({((((,,,|}||||,}.}})).})))||||((((......)))).})))....,))))).}))),...)).))...)))))).......)))))),,))))......))))))).)))))))...)))).))))...))))).....(((((((....)))))))..{(((.........}))).))))))|(.((((((....)))))).)}((((((..((((({,{.,((({,....(((((((...(((.(((.(((((....(((,....,}.))}.(((.........)))......})))).))).))).)))))))......((((..........))))..{((({(..(((((({..(((((.(.....).)))))))))))),}),)}},}))))..,))))))..))))))...,))))).))).(((((......))))).......
Back