Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-WDR26-1:19
Sequence Length
684 nt
GC Content
0.5234
GCAGCGCCGGGGGCUGAGGAAAGGUGGGUGGCGAAGCGCCGCCGGGCGCUUGGUGGCCGCUGCCGCCGCCACUGCAGCUGUGCACGCCCGCCUCUCGGAGGAAACUUGAAGCCAGCAGUACAAGCAGGGCUGGAGGCCGAGCGGAGCCAUCCGACCUUGGGACUAGGGAAACGUGGACUUGGUGGGCUAUUCUGCGCUGAAGAGGCAGCAACGAGGGCUCGGUGGUAUUGGUGUUGGUCCUAGUGGAAUUGUCAAGAGGAUGCUUUUGAAGUGGCCCAGCAUCUUGGAAGUUCACCAUGCUUGCUUUGCAAGAGAUUCCUGACGCUGCAGUGAAAGAGGUCCAGUCAUUCCAGAGAGAACUUCAGUUUCAGACAAGUCAUCAAAUCCAGAAAGCAAGGAAAAAUACCCUGAAAGACGACUGGCAAAUCUCGGUGAAAGAGUAGACGCACUUCAUGGAUUGGAGUGAAUCUUAGAGCACCUGGUACCUUGCACAGGACCUGAUGCCUGGAGGUACAGCAGCCAUCUUGUGACCAUAAGGAGGAAAUCAACGCAUUAAGAAGGGAAAAGCUAAGAAGAUACAGAGAGCAGGGACCACUGACAACAUGAUCAAGCCACUCUACCAGGCCUUAACUUCCUAUUCCCUGACUUCUUAUUGAAAGAGACAAUAAAACUUCUCAUUUGUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-219.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -231.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((...)))((((((((((((((((((.(((((((....))))))).....((((((((.(((((.((((...(((((..((..((.((...(((....))))).))..)).))))).))))))).)).)))..))))).))))))).)))))((((.((((((.....((.((((((((((......))((((......))))..(((....)))(((((..(.((((((.(((....)))....(((((((....)))))))((((((((.((.((((((...(((.((...(((((...))))).(((((((...(((((.......(((((((((((.((.(((.((..((((..(((...)))))))..))...(((.........)))........)))...)).))))))...)))))((((.......(((..(((((((.....)))))))..))).....))))..(((((((...((((........))))))))))).)))))...(((((....))))).))).)))).............)))))...))))))...........)).))).)))))..)))))).)....))))).)))))))))).....)))))).)))).......((((((.......))))))...)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{{,(,..,,))||((({((((((((((((.(((((((....))))))){(((((.({.,,,))|||},|{(({....})),(((,.((((((,.{((....))),,{(((.((.......))..)))))))))).).)))..))))))).}))))((((.((((((.....((.(((((((((({.,{{,||((({....,,)})),..}}.}))}}((((((.,(,((((((.(((....)))....(((((((....)))))))((((((((.((.((((({...(((.{{...(((({..{||,,|.{{(((((...(((((.......(((((((((((.{{.,,{.((..((({..{{{...}}}})))..))...{{{.........||,.......,))}...,,.))))))...)))))((((.......(((..(((((((.....)))))))..))).....))))..(((((((...((((.......,))))))))))).)))))..{(((((....)))))})))}},))...))}.,,,}..)))}}...))},)),......,,,,)).))).)))))..)))))).}.,,,)))))))))))))))).....)))))).))))....,{{{(,,,{.,.|||.}},,,....})))),.......
Back