Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-WDR26-1:6
Sequence Length
4935 nt
GC Content
0.5027
AGAUGGCGAAGAAGAUGAGCGCAGCGCACAGCACCAGAGACAGCAUGUAGCAGAACGCAGCGAAAGUGAAGGCCAUGGCCGGCGGACCCCAAUCCCACCACACACGCCAAGAAGCCCCUAGGAGCCCGAUGCCUCCCUAGAGGACCGCACUCCCUCCAAGGAGCCGCGUCUGCACGCUCCUCUCCAGGCUAGUGCCCAGGAGGGCGCACAGCUAGCGAAGCGACUCGAGGGUCAGCGAAUAAGCGCUGGAUUCCCGCAGGCUCCGGCGACCCCAGACCCGGCCCUCCGGCGAAGACAGGAAAACGUGUGUCGAGAGUCGCUGGAGGGAACCGUCCGCAAAUCGAAGAAGAAACCAAAUCAGCAGCGAACACCUGCAAAUUAGUGCCAAGCUGUGAGCCCCUCGAGACCAACACGACAAGCGAUGCGACGACUCCACGGAGGACCGAGGGAGGAGGUCCCAUUCGCCCCAGGAAGAGCUCUCUGCUUUUCUCCACUAAACCGCUGAGGAGAGACGAGCGCUCCGCUCCGGACCCUCCCGCGCCACCGGGGCGCAAACGGAUAGUGUCCAGCGAGGUGCCCGAGCGGCCUCCGAGCUCCUCCCAAAUCCCAGAGCCGGGCAGCGCUCUUUCCCGAGAGAAGGAGUCUUUAGGUAGCCGGGAGGAGGUAGGUCCCGUUGGUCCUGCGCCCCAGACGCGGCUUCCAGCGCAGCCGUGCGCUCCGAGGCGCGCCCGUCCCCAACCGUGACUCCGGCCAGCCGGCCUCCGCAACCCAAGUGUCCCGGAAACCGGGGGUCGGACCGGGGCGAGCACUGGCUCCACCCAACGGGCCAACUCCAGCCCGGGUGGCUGCAGCAGUGGGUUUCAGGCCAAACGCUGUAGCUCGCUCCACCUGCUGCUGCCGCUGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCUUUGCCACUGCGAGAACUGUAGCGGUGCGACCCGGGAUUCCCUCCUCUCGGCGCCCCACCCUCGACUCCUGUUCCGCUGAGCGCGCCCUCCCCGGCGGGCGGAGACUGCAGCGCCGGGGGCUGAGGAAAGGUGGGUGGCGAAGCGCCGCCGGGCGCUUGGUGGCCGCUGCCGCCGCCACUGCAGCUGUGCACGCCCGCCUCUCGGAGGAAACUUGAAGCCAGCAGUACAAGCAGGGCUGGAGGCCGAGCGGAGGUGGGGCGGGACCGGUUGGAGCAGGGACUCUUUAAACACGUGCGUCUGGAGGAGGUGGGAAGCUGCGGAAGGGUAUGGUGUGUGCCUCGCGCCUAAACGCCGCAGCCGCCCCUCCCGGUUCUUGCAGUUUCGCCUAUCGGAGUGGGAAGUGUGGGGACUUGGGGCGUUGCCUAGUGUUGGUUGGGGAUACAGUGCAAGCCUUGGAUCCCAAAGCUGCUUGGAUGGAUUUUACCAAACUGUAGCAUACUCAGUGCUUAGGGCUGCGUUUACUGCUCUGCUCCCAGACCCUGCAAAAUUCUCCAUUAACGUCCUUCCGUUGCAUCCUCUACCCUCCCCAGCCAUCCGACCUUGGGACUAGGGAAACGUGGACUUGGUGGGCUAUUCUGCGCUGAAGAGGCAGCAACGAGGGCUCGGUGGUAUUGGUGUUGGUCCUAGUGGAAUUGUCAAGAGGAUGCUUUUGAAGACCUGAUGCCUGGAGGUACAGCAGCCAUCUUGUGACCAUAAGGAGGAAAUCAACGCAUUAAGAAGGGAAAAGCUAAGAAGAUACAGAGAGCAGGGACCACUGACAACAUGAUCAAGCCACUCUACCAGGCCUUAACUUCCUAUUCCCUGACUUCUUAUUGAAAGAGACAAUAAAACUUCUCAUUUGUUUUAACCCAUAGAAGUAAGGCAUUCUGUUACUUAUGGGUGAACACAAUUCUUAACUGAUGCCAUGGUUUAAUGGGAGUAGGGAUCCUGGUAUGACAGGAAAUUGAGAUAAUCAGUUUAUGGCUAGUGUAGCAGCUCCAAGACACGAUUAAUGUCCCAAGCUCUUUUGCCCUCCUGACUUGCUAGCCUCAGUAUGUGGAUUUUGUUCUCCCAGUCUGAAGGCAUAACUUUUGGGGAAGAGUAAAAGAAGCCCUCUCCAGAGAUCUGCUACAUCUCAUUGGCCAGAACUCUAACAUUUGGCCGCCACUACCUAGUUGCAAGUGAAUCUGAGAAGGUGAGUGUUUUUUCAUUUCAGGCUUUAUGAAAUAGAAAGGCAAAGGAAGGGGGGUUUGAGCAGCCUUUGAACAGCCAGUUCACGUUUUUGCUAUACUGCUCUAGUCAGGUUUUCUAUUACCAGCAGCCUAAUACAAUUUCCAGGUGCCCCAAGUUGUGCUGACAACUUGGUGUAUAAGAGAGACAGUGCUUUGGGGUUAGUAUGAUCAGGGAAAGUUCACUGACAAAGUGGCAACCUAAGGCAAAUUACAUCACACUUUUUCUCUGCUUGUAAGUAAGUCUGAAUGUUCCAUGUUUUCCUGACCUAUUCUUAACCGAUUCCUGCUCCUCCUGAGUUGUUAUACAUAAAUUAGUUUUGGUUUUCUGCCUUCUUCUAAUAUAUAGCAAUACCUCUGUUUAUUGAAGGUGAAGGCAAAUACAGUUUGCAUUAGUCUGUUUUCACACUGCUAUAAAGAUACUACCUGAGACUGGGUAAUUUAUAAAGGAAAGAGGUUUCAUUGACUCACAGUUCAGCAUGGCUGGGGAGGCCUCAGGAAACUUACAAUCACAGCAGAAGGCAACGGGGAAGCAAGGCACAUCUUACAUGGCAGCAGGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGUGAAAGGGAAUUGCCAAACACUUUUAAACCAUCAGAUCUUGUGAGAACUCACUAUCAGGAGAAUAGCAGGGGGAAACCACCCCCGUGAUCCAGUCAUCUCCUACCAGAUUCCUCCCUCGACACAUGGAAAUUACAAUUCAAGAUGAGAUCUGGGUGGGAACACAGAACCAAACCAUAUCACAGAUGCUCCUUAUGAUAGGGUUACAUCCCAAUAAACCCUUUGUAAAUUGAAAAUAGUGUACAUCAAAAUGCAUUUAAUACAUCGAACCUAUCACACAUUAUAACUUAGCCUAACCUACCUUAAAUGUGCUUAGAAUACUUACAUUAGCCUACAGUUGGGCAAAAUCAUCUAACACAAAGCCUAUUUUAUAAUAAAGUAUUGAAUAUCUCAUGUCAUUUAUUAAAUGCUGUACCAAAAGUGAAAAAACAGAAUGGUUUUAUGGGUACUUGAAAUGUAAUAUCUAUUGAAUGUGUAUCGCUUUGGCACUAUUGUGAAGUUGAAAAAUCUUAAGAUGAACAGUCAUAAGUCGGGGACUGUCUGUAAAGUGUACCCACACAACUGAAGACUUGGUUUAUCAUGAAGCUUUUUCCAACCUUAUCUCCUAUCUGCUCUCCCCUUACAUUCCUGUCUCCACCCUACCCUCAAGCAUCCAUCAGAGAAAUGGUCAAAGCGUAAAGGGGAAUGCCUUUGGAUUCAUGGGAAGCUCAGUUAAGUGGGCUGUGAGCCUCCUCUUGCCCCAUCACUCAUCCUGUUCUGCCCACAGGAAAAUCUGACCAUAUGUUUCAUUUAACACAAAAUUCGAGAGUAUCUCCUAAACAGUAUUUUCCCCCAUAAAUGAACUCUGUAAACUUUUCAGUGCCAUAAAUAACUGGUAUGAUAUAUCAAGUUACUCUCUUGCUUCCCAGCCAAGCCCUGUUGAAAUCCCAGAAAGCUUUCCCCAUCCUCCAGCUUAAAUCCAGCUCACCAAGUUCUCACUCCCACCUCUCAACACCCCCAUCCAAACACUCCCUCCAGUCCCCACCACAAAGAUACUCUGCCCUGGCUAAGCAACCACCCCUAAUACUGUUUCUCUCUUGGUGGGGUUUGGAUGUUUAGAAUGUCCUGAGAAUUGGGGUUCUUUGAGUGUUUAUUAUAAAAUUUUAAAAGAUGUAGAAGAAUAGAGAGUUUAGUGAACAUUCAUCUACCUAUCUGGAUUCAGCAACUGUUAGCAUUUUUGUGCUUUGAGUUGUUUCAAAAUUGUGUUUUACAGCUGGUUUGUUCAAACCAGGAUCUAAAGAUUUUCUCACCCCUCAGUGUUACAGUAGCUAGGCAGGCAGAGAUGAGCAGGGCAGGAGAGGACCUCCCUCCAACAACAGGCAUGCCAGGCAACCAUCAGGUCAUGGUCAGGUGAUUGUUAACUGUCUCUCUAAAAUAAUAAUUGGUUGUGGCCCCGUGCCAGAGAGAGGCAGUCUCCCAACAGAUAGAAACACCUGAAACUGGUAAUCAGCAGCUUCCCAAUAAGAUUUCAGGAGUUGGGCGAGUGGGCUCAAACAUGUGCACUAAGAGGCAAAAUGGCAGAGUUUAAAGGGUAUAUGAACACUGGGUAAAGGAAGAAUUCCUCAAGUGAGCACGUGUACAACUUCAGUAAACACACUGUGCAUGUGGCCCCUCCCAACUGCUGGCAGGCCACUGUGCAUGUGGACAGCCCACCCCAAGGGAAGCAUCAGGGUAAGGGAGGAGACCACCCCUCAUAUUGUCUUAUGCCCAAUUUCUGCCUCCAAAGAAAGAAGAAGUAAAAACUAAAAGGCAGAAAUGAAAUUCUCAGGCAGACAGCCCGGCGCCGUGCCCUGGGCCUGGUUAAAGAUCGACCCCUGACCUAACCAGUUAUGUUAUCUAUAGAUUCCAGAUAUUGUAUGGAAGAGCAUUGUAAAAAUCCCUGUCCUGUUCUGUUCCGUUCUGAUUACCAGUGCAUGCAUCCCCCAGUCACGCACCCCCUGCUUGCUCAAUCGAUUACGACCCUCUCACGUGGACCCCCUUAGAGUUGUAAGCCCUUAAAAGGGACAGGAAUUGCUCACUUGGGGAGCUCGGUUUUUGAGACAUGAGUCUUGCCAACACUCCCGGCCGAAUAAAGCCCUUCCUUCUUUAACUUGGUGUCUGAGAGGUUUUGUCUGUGGCUAGUCCUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1630.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1725.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 1085.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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