Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-WDR26-1:9

Sequence Length

1005 nt

GC Content

0.5493

AAACGCUGUAGCUCGCUCCACCUGCUGCUGCCGCUGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCUUUGCCACUGCGAGAACUGUAGCGGUGCGACCCGGGAUUCCCUCCUCUCGGCGCCCCACCCUCGACUCCUGUUCCGCUGAGCGCGCCCUCCCCGGCGGGCGGAGACUGCAGCGCCGGGGGCUGAGGAAAGGUGGGUGGCGAAGCGCCGCCGGGCGCUUGGUGGCCGCUGCCGCCGCCACUGCAGCUGUGCACGCCCGCCUCUCGGAGGAAACUUGAAGCCAGCAGUACAAGCAGGGCUGGAGGCCGAGCGGAGGUGGGGCGGGACCGGUUGGAGCAGGGACUCUUUAAACACGUGCGUCUGGAGGAGCCAUCCGACCUUGGGACUAGGGAAACGUGGACUUGGUGGGCUAUUCUGCGCUGAAGAGGCAGCAACGAGGGCUCGGUGGUAUUGGUGUUGGUCCUAGUGGAAUUGUCAAGAGGAUGCUUUUGAAGUGGCCCAGCAUCUUGGAAGUUCACCAUGCUUGCUUUGCAAGAGAUUCCUGACGCUGCAGUGAAAGAGGUCCAGUCAUUCCAGAGAGAACUUCAGUUUCAGACAAGUCAUCAAAUCCAGAAAGCAAGGAAAAAUACCCUGAAAGACGACUGGCAAAUCUCGGUGAAAGAGUAGACGCACUUCAUGGAUUGGAGUGAAUCUUAGAGCACCUGGUACCUUGCACAGGACCUGAUGCCUGGAGGUACAGCAGCCAUCUUGUGACCAUAAGGAGGAAAUCAACGCAUUAAGAAGGGAAAAGCUAAGAAGAUACAGAGAGCAGGGACCACUGACAACAUGAUCAAGCCACUCUACCAGGCCUUAACUUCCUAUUCCCUGACUUCUUAUUGAAAGAGACAAUAAAACUUCUCAUUUGUUUUAACCCAUAGAAGUAAGGCAUUCUGUUACUUAUGGGUGAACACAAUUCUUAACUGAUGCCAUGGUUUAAUGGGAGUAGGGAUCCUGGUAUGACAGGAAAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-364.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -382.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 204.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...........((((((((.((((((.(.((((.(.(((((.(((((.((((((((((((((.((((..(.(((((.((((.(((..((((((........))))))))).))..(((((.((((((...((((((((.(((((........)))))..).)).))))).)))))).)))))..(((((((((...(((((((....)))))))((((((.((....)).))))))(((....))).))))))))).(((.((....))))).))..))))).)..))))))).))))).)).)))).)))))))))).).)))).).))))))....(.((((((.((((((((.((.(((....)))..))..((((.((((((.....((.((((((((((......))((((......))))..(((....)))(((((..(.((((((.(((....)))....(((((((....)))))))((((((((.((.((((((...(((.((...(((((...))))).(((((((...(((((.......(((((((((((.((.(((.((..((((..(((...)))))))..))...(((.........)))........)))...)).))))))...)))))((((.......(((..(((((((.....)))))))..))).....))))..(((((((...((((........))))))))))).)))))...(((((....))))).))).)))).............)))))...))))))...........)).))).)))))..)))))).)....))))).)))))))))).....)))))).))))....(((.....))).((((..........))))...(((((..(((((((..(((((.(.....).)))))))))))))))))............)))).)))))))))).)))))).))).(((((......))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....,.....(({{((((.((((((.(.((((.(.(((((.(((((.(((((((((({(((.((((..(.(((((.({((.(((..((((((........))))))))),)}..(((((.((((((...((((((({.(((((.,....,.)))))..}.)).))))).)))))).)))))..((((((((({{.(((((((....)))))))((((((.{{....)),)))}}|{{{....))),))))))))),{|,|{(....)))},.)}..))))).)..))))))).}))))},).)))).)))))))))).).)))).).)))))).,,,(,((((((.((((((((.((.(((....)))..}}..((((.((((((.....((.(((((((((({.,{{,||((({....,,)}))...||,}}}},((((((.,(,((((((.(((....)))....(((((((....)))))))((((((((.((.((((({...(((.{{...(((({..{||,,|.{{(((((...(((((.......(((((((((((.{{.,,{.((..((({..{{{...}}}})))..))...{{{.........||,.......,))}...,,.))))))...)))))((((.......(((..(((((((.....)))))))..))).....))))..(((((((...((((.......,))))))))))).)))))..{(((((....)))))})))}},))...))}.,,,}..)))}}...))},)),......,,,,)).))).)))))..)))))).},,,,)))))})))))))))).....)))))).))))....{((.....}}}.((({..........})))..{((({{,.(((((({..(((((.(.....).)))))))))))),}}.)}},.........)))),,))))))))}.}))))).))).(((((......))))).......