Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-WDR70-7:14
Sequence Length
604 nt
GC Content
0.5050
AGCGCCGGGCUUUCCUCGCGCCUGUCGAAGGCCGGCCUUCCCGCUCGGGUGUCUCGCCCUCUCGCUUCUCCGCAGGGCAGGAGGCAGUGGCGAGAAAAGGAGCUGCCGGCCGGAGUUCUAGCACCGAGAAGGAGAGUACUGGAAUACCUGAGUUUUGGCUGGGCACAGAACUGUCUGGAAUACAGACUGCAAUUCCCAGCCUUCUGUGCAGUUCUGUGUGGCCAUGUGACUAAGUUGUGGUCAAUAUGAGUCACGGAAGAAUAGAAGAACAACUCAGAGGAGGAAGAAGUCAGACAUAGCCAGACACGGCUGCUAGCAGUUCCACCAAUGAAAGAGGAGACCAGGAUGUUUAAAACAGGCAAACACAAGGUGCGAAAAACCAGAAGCGAAAACUUCUGAGGUCAUUUAAGCAAGGACUAUCGUUAUCCCCGGAAGCAGAGAGAAGUUCCCUUUGCCCAACAUCACACUGCAAGCACGUGUUGGAGCUGAGAUUCAAACCCAGGCAUCCAGGGUCCAGGGCCCAUGCUUUUAAUAUAUUCCAUAUCUUAGGAGAAUUUCCCCUAUUUAAACAAUAAAAGUGCAAAAAUCUUGUGGCUAGCCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-190.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -202.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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