Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-ZBTB20-1:2
Sequence Length
4776 nt
GC Content
0.3922
AGCUCUAGGGCAGAGAACAAAAGAAUUGCAAAAUGUAUUCAGCACCAAACAAUGCUAAACCAAGAAACAUCCAAUCACAAAACUAGGAAGUUUGGCAAGAAGUGGUUAGAGAAAUCUCUGGGCUUUUCCAUGGGCAGGGUCGACAGACUCUCUUUUCAGUGAUUUCUGGCUCUGAGAAACCUCUUUACUCACUAGAAAAGAACUUUAUUUAAAUGGCCAAUUUUGUUCCUCAGAAAAAGAAAUUAAAAAAAAAGAAAAAUAGGAUACUGAAGACAGAACCAUGUGACUUGGUGACAAACAAAAGGAGGGGUGCACUAGAAUUUCAAUAGGCUCCCUAAUUCCAUAGAAAAAGCAAAGCAACCCAAUGCCUCCUGAGCCUGCAGUGCAUGAAGAGAGUGCUUGAGCUGACCCAGCCACCAGGCCUUCUGGGGCUAGACAUAACUUCCCACUGGAACAGCAGCAGCCUCUUUCCCCUCUUUGUGUUUUCAUGAAGAAAACGGCUGUUCUCUUAGGUAGCCAGGAAAUAGAUUACAUGGGGCAAACUUUCAAAAGCAAUCUCUACCCUGGUGCUCAGGCUACAUACAGAGGCAGAAAAGGGGCACGGAAGAGCCCUUGCUCUUGAGAGAGAGUAUUUUCAUAUUCCCAAGGGCUUUCCGUGUAGAGUUGCUAUUUCUGAUAUCACUUAAACCUUUACAAGAAAAAAGGCUGUGGUGACUCAGUGUUCCUAUAAAUUCAGAAUGUGGAAACUACUAAUCCAAAGCAUCAUUUCUAGCACUGAGUAUCAAGACGAUCAGCCUGACCAAAAUAUUGCAAAGAGUUUUCUAAGUCUCUGAAGAUUUUUUUCUCCUUGAACACUGAGUCUAUAGCAGUCAGCAAUGUACCUUAGCCGAUCCCUGGGAAUGGUUAUGGAACAGUAGGGCUUGUUUCCAUCCUUUUUAGAGUGAAGAGAUAGAAAAUUAGGGCUACCUAGUGUGGGUUCUUUUUCAGAACUAUGUAUUUUCUCCUCACUGCAUGAUGGGUAAAAAUGCCCUGGGUUGAAACAAGAAACAUUAUCUUUCCACACCACUGACUAAAACACCUGCCAGUGGUUUCUUUAGGCUCCACCUUUUGCUCCGUAAACUGUAGACUUUCAGACUGAAAUCUAAUCUUAAGUGACCUCAAUUAAGGUAUUUUCACAAAAGGCUACUUAUAGUGUAGCAUUAUUGCCUUAAAUCAGAAAGCCCUGGGAAGAGGAUAAAAGAUAUAGAAAUGAGAAGGCUCUGAAGUUAUAGGCAUUUCUUGCUGUUUAAUAGUUACAUUAUCACAAAAACAAGCCCUAUUCAUGAUUGAGGACUAUGGAAAUAGUGACUUCUUGAGGAGGCACCAAACUUUCCUAGAACUGGGUACUCUCAGAUAGUGGCUGCUAUUUCCUAUUCUAUUUCAGUGACGUAGGUUGGGGCUGAAUGUAAAAUAGACAUCAUAUUACUAAAUAGAAUCCUAUAAAAUGCAAUCACAGGUGCCCGGGAGUACUAGUUUUAAACAUUUCCUUAACAAGGAGAACAAUCCAGCAAAAAGCUUUCUUUCUCUAUACAGUGUAUAUCUCUAAACUUUUUUUCCUCAGUUUUAGAGAACAUCUGUUUUAUCUGGUGGUUCUUUGUUUGAAUGCAAACUCAUAACUUUCAAGUCUCCGGUGCAAGAGCAUAAUCUACAGAUCAUGGGCAAAAUCUAGCCACAGUCCUGAGAGUCCAGGCUUCUGGGAUGCCCAGCUGGGUAUAAAAGUCCCUACUAACCCUGUUUCAAAUUCAGAGGUUUCUUUGGUUUAGAAUGCCUCAAUGAGAUUUUGAUACAUCCAAGAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAUUUUUUUUUUUUUUCCAAAAAAAGUAAAACCAGAGUUUCAGGAACUCUUUAUCCACAGAGGCUAAUAGAAAUAGAAUUUGGAAAUAUCUAUCUGAGACAUUUUUAAAUCUGAGGAAUCCGUAAAAUGGUGGCUCUUGGGUAUCCAGCCCUCAGGAUCUCCAUUUACCUGUUAAAGUGAGGAUUUGGUGCCUUUCUUCUUUAGUUGGGCCAUCAAGAAAACUUCAGAAAUCAGGCAUUCUGUCUUCCUAUACAAUAAAUAUUUUCAGAUCAUAUUUUCAGAUAAGAGUCUUCAGCUUCCCUCAGCUAUUCAACCCAAUGCAUGGAAAGCCUCAGUUGAAUAAACUUUUCCACCAUCCCAGGUGCCUGAAACUAGUGUCCUUCUUCACUUCUACAUUCAGGACAAAAUGAAGUCAGGUUUUUAAAACCUCAGUAUAAAAGACCCCCUCACACUGGUCCAAUAUGAAGACUUCUCAGCGUGAACACUGGGGAAUUCCUUCCUUUCAUCUUUCCUAAUAGAUUGUUGUUUUCUAAUCCCAUCCCAUUCUGCUGGAUGCAUUCCUGAAGAUCUCUGGUGCUGAAGGGCCUCGAGUUCCUUUCAGAGACUGUAUUUGACACACUUUAGGUACACACAAACGAAUGGUAUCACAUGCAAUAUUUUAAUGGAGCAAUGGGAGAGGCUCUUUGAAAUGGGGUUUGCAUCUUUUUGUAACAUUUUGAUUUCUCUGGUGCCUUAUUCCUACUUGAUGCUGGCACUCACAUACCCACAAGAAGCUGACACAGAAGUCAGCCUUAGGCGUGGGGACAUAUGGGUGAUGUUUGAGCAUGCAGGGGCCAUGGGGAGUUUGGUGUCAGUUGGUGGAGAAGGGACUAGAUGGCAUCUCUUAGCCGAGGCCAACAGGAACUGCACAAGUCCAUUAUAGUCAAAGUUAGCAAUUUUGAUACGUAAACACAAUACUUCAUUCUUCCUCAUCUGAGCUUUCCUUCCUUCUUCCUUUUCUAUCUCUACCUUCUCAUAAAGGUGCUGCUGCUGCUGCUAAGGUGCCCGGAGUCCAGAAUGUCCAUUAAUCACUCAGGCACGAGCCUGGCACUGCCACGUCAGCCCCCAGCAUGACCAAACCCAGGUUUCUCUUGCUUGGGGCUGAGAACUGUCAGAUUUUUCUCAUCAAAAAUGUUUUCCAAGGAAUCAGUGGAUUACAGUUUUUCUGCAUUGAAAAUGCACUUUAAAAAAUAAAUUAAAGCUCCAGACUGUUUAAAAUAUACAGAGGGAGCAGGGGAAAGUUAAGCAUGUGCUAGUGUCUGAACCCAGUUCAGUUUAUCUCCAGUUGAAACGAUAUACACUAUAUUAUGUAUAAAUGUAUACACACUUCCUAUAUGUAUCCACAUAUAUAUAGUGUAUAUAUUAUACAUGUAUAGGUGUGUAUAUGUGCAUAUAUACACACAUGCACAUAACAAAAUCAGAUGCUCAUUACAAAUCCAGAUGCUCAUUACAAAACCAGAUGCUACACAAACAGCAGCAGAGGAAACAAGGUUGGACUCUUGCAACAGAUCACAAAAAAUAAAAACAGCUACUUGCAGUGACUUUGGUCAUUUCUGUAUGUUCAUAAAGAAUGGAUUGUAACAAGGAAAAAAAGGAACAGUGUUAGUGAAAAAGGAAAAAUGGGCGAAACCAUCUUGAUCCGAUGCGAAUGCAGUAAUGUUCUAUAUACCAUUUCAUCAGUUAUUUCUUUUAGUCAUGUUGAUUUGAUUUCAGUUUCUGGCUAUGAAAAACAUUUUUAAACUCGUCACCCACAACAAACUGAACAAAACUACUACAGUGAAAGCCCUUUUCAGUGAAAGAUGUCAGAAACCUCAAAACCUUUGGCCUGACUCAGAACUACCAUGUGAAAAUCAGUACUCUCUUAAUGUUUGAAAUAAAAACUGAAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACCUUUUUUGAAGCACCUUAACGUGGCCAUCCAUUUGAGAAGUGGGUGCCACUUUUUUCUUUGAGCACCUUAUUGAUGUGUUUGCUAUCUGCUGUCUUUCUGUUACCUGUUGGCUGAAUGGCUAGCUGUUAACAUAUACAUGUGCACAGAAGAGAUAUCUGGGCAUGUAUGUUCUCAAUGAAGUUUACUGUGGUGACUGCUGAAAGGUGAACCCAUUUCCUGAUUUUCCCGCCGCAGUGUUGUGAUAAGAUUCGAAGAAACCUUUUUCCCUGCACAGAAAUGUUACACACUGUAUGUUUAUGUGACCUAAAACAUACACACAUGCACACACACAUACAUAUCCAUUCAUUCAUUCAUUCAAGUGGUGUUUCCAGUGUCUGUGUGUCACUGUUUAUGCAGUUUCCAUUUCCCAGUGAAUUAUGAGUGGAGGGCAACUUUUCUAACCAGAUUGUCUUUUCAGAACAAAGACCUGGGAAUUGAGGAAGAGUUUGGAAAGAGGGAGAGGCAAGGAAAGAGAGCUUUAAAUUGAAAGGUUAAUUUCCUAAGAGGAACCUGGGCUGAAUGACUGCAGUGUUAUACCCUCCAAUCUUUGCAGGUGGGCAUGGAACACUGCUUGUAUCACUCUGUGCACGGUAUAAAUCCAUAUAUCCACAAAAACACACAUCCAUCCAUCAACAUAUACAUGGUUUGGGAUGAGCAGGUCAAUAGUUUUGAGAGGGAGUUUGUUCCUUUUUUUUUCUCAUUAUACUCUUAAAUUGUUGUCAGUUAUCAAACAAACAAACAGAAAAAUUGUUUGGAAAAACCUUGCAUACGCCUUUUCUAUCAAGUGCUUUAAAAUAUAGACUAAAUACACACAUCCUGCCAGUUUUUUCUUACAGUGACAGUAUCCUUACCUGCCAUUUAAUAUUAGCCUCGUAUUUUUCUCACGUAUAUUUACCUGUGACUUGUAUUUGUUAUUUAAACAGGAAAAAAAACAUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1258.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1359.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 1163.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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