Basic Information
Symbol
AATF
RNA Class
mRNA
Alias
apoptosis antagonizing transcription factor
DED
CHE-1
CHE1
BFR2
protein AATF
rb-binding protein Che-1
Protein AATF
Apoptosis-antagonizing transcription factor
Rb-binding protein Che-1
Location (GRCh38)
17:36948925-37056874
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_012138.4
Sequence length
2062 nt
GC Content
0.5276
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-698.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-736.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
566.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001411094.1 | GCGCCUCCCGGAAGUGGCCGGUCCAGAGCUGUGGGGUGGCCUCCGCGCG… | 1990 nt | 0.5317 |
| NM_012138.4 | GCGCCUCCCGGAAGUGGCCGGUCCAGAGCUGUGGGGUGGCCUCCGCGCG… | 2062 nt | 0.5276 |
Summary
The protein encoded by this gene was identified on the basis of its interaction with MAP3K12/DLK, a protein kinase known to be involved in the induction of cell apoptosis. This gene product contains a leucine zipper, which is a characteristic motif of transcription factors, and was shown to exhibit strong transactivation activity when fused to Gal4 DNA binding domain. Overexpression of this gene interfered with MAP3K12 induced apoptosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
