Basic Information

Secondary Structure

MANE Select
NM_003741.4
Sequence length
3540 nt
GC Content
0.6610

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1709.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1762.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 828.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001304472.2 GCAGUAGAGCCGCGUACGGCCCGGGUCAGCGCCCGCCCGCCCGCGCUCC… 3537 nt 0.6610
NM_001304473.2 GUUCGCGUCAUGCCGAGCCUCCCGGCCCCGCCGGCCCCGCUGCUGCUCC… 4220 nt 0.6182
NM_001304474.2 GUUCGCGUCAUGCCGAGCCUCCCGGCCCCGCCGGCCCCGCUGCUGCUCC… 4165 nt 0.6192
NM_003741.4 GCAGUAGAGCCGCGUACGGCCCGGGUCAGCGCCCGCCCGCCCGCGCUCC… 3540 nt 0.6610
NM_177978.1 CCCGGGUCAGCGCCCGCCCGCCCGCGCUCCUCCCGGCCGCUCCUCCCGC… 3561 nt 0.6571
NM_177979.1 CCCGGGUCAGCGCCCGCCCGCCCGCGCUCCUCCCGGCCGCUCCUCCCGC… 3506 nt 0.6589
Summary

This gene encodes a secreted protein that dorsalizes early vertebrate embryonic tissues by binding to ventralizing TGF-beta-like bone morphogenetic proteins and sequestering them in latent complexes. The encoded protein may also have roles in organogenesis and during adulthood. It has been suggested that this gene could be a candidate gene for Cornelia de Lange syndrome. Reduced expression of this gene results in enhanced bone regeneration. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Other alternative splice variants have been described but their full length sequence has not been determined. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image