Basic Information
Symbol
CHST8
RNA Class
mRNA
Alias
carbohydrate sulfotransferase 8
GALNAC4ST-1
carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8
GALNAC4ST1
GalNAc4ST
PSS3
GALNAC-4-ST1
GalNAc-4-O-sulfotransferase 1
N-acetylgalactosamine-4-O-sulfotransferase 1
Carbohydrate sulfotransferase 8
GalNAc-4-ST1
GalNAc4ST-1
EC 2.8.2.-
Location (GRCh38)
19:33621942-33773509
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001127895.2
Sequence length
2225 nt
GC Content
0.6521
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1015.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1048.1 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
689.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001127895.2 | ACUUCGCUGGGAGCCUUCCCGGCGCGCAAGCCGGAUCCGGCAGUGCUGC… | 2225 nt | 0.6521 |
| NM_001127896.2 | ACUUCGCUGGGAGCCUUCCCGGCGCGCAAGCCGGAUCCGGCAGUGCUGC… | 2148 nt | 0.6639 |
| NM_022467.3 | GGGACUCGUCCCAGAGUUUGCUGCCGCCGCCGCCGCUGCCAUUAGAGCG… | 2496 nt | 0.6366 |
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the sulfotransferase 2 family. It is predominantly expressed in the pituitary gland, and is localized to the golgi membrane. This protein catalyzes the transfer of sulfate to position 4 of non-reducing N-acetylgalactosamine (GalNAc) residues in both N-glycans and O-glycans. It is responsible for sulfation of GalNAc on luteinizing hormone (LH), which is required for production of the sex hormones. Mice lacking this enzyme, exhibit increased levels of circulating LH, and precocious sexual maturation of both male and female mice. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
