Basic Information
Symbol
CIRBP
RNA Class
mRNA
Alias
cold inducible RNA binding protein
CIRP
Cold-inducible RNA-binding protein
glycine-rich RNA binding protein
cold inducible RNA-binding protein
A18 hnRNP
testicular tissue protein Li 39
A18HNRNP
Glycine-rich RNA-binding protein CIRP
Location (GRCh38)
19:1259384-1274880
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001300829.2
Sequence length
3346 nt
GC Content
0.5708
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1342.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1396.84 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1085.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001280.3 | CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… | 1333 nt | 0.5191 |
| NM_001300815.2 | CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… | 1091 nt | 0.6269 |
| NM_001300829.2 | CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… | 3346 nt | 0.5708 |
Summary
Enables mRNA 3'-UTR binding activity and small ribosomal subunit rRNA binding activity. Involved in mRNA stabilization; positive regulation of translation; and response to UV. Located in cytoplasm and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
