Basic Information

Symbol
COG3
RNA Class
mRNA
Alias
component of oligomeric golgi complex 3 SEC34 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 CDG2BB COG complex subunit 3 p94 tethering factor SEC34 vesicle-docking protein SEC34 homolog Component of oligomeric Golgi complex 3 Vesicle-docking protein SEC34 homolog
Location (GRCh38)
13:45464898-45536701 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001204476.1
BLAST PRIMER
NM_031431.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_031431.4
Sequence length
4555 nt
GC Content
0.4167

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1303.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1391.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 981.1
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001204476.1 ACCGUUUCCGGGGUCAGGGCAUUCCGUCCCGCCCCGCCGCCGGUGCAGU… 2884 nt 0.4164
NM_031431.4 GCAGUGUUGGAAGCUCCGGUUCUCCCGGAAGUGGCCCAGGUCUCUCUGU… 4555 nt 0.4167
Summary

This gene encodes a component of the conserved oligomeric Golgi (COG) complex which is composed of eight different subunits and is required for normal Golgi morphology and localization. Defects in the COG complex result in multiple deficiencies in protein glycosylation. The protein encoded by this gene is involved in ER-Golgi transport.[provided by RefSeq, Jun 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image