Basic Information

Symbol
CPEB3
RNA Class
mRNA
Alias
cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 KIAA0940 cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3 CPE-BP3 CPE-binding protein 3 hCPEB-3 Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3
Location (GRCh38)
10:92046692-92291628 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_014912.5
BLAST PRIMER
NM_001178137.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_014912.5
Sequence length
7781 nt
GC Content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2211.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2368.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2397.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_014912.5 AGAGGCUGCACAGCCCGCCCGGACCAACGCCUCCGCGCCUGCCGCCGUC… 7781 nt 0.4214
NM_001178137.2 ACAGUUGUCAAAGUGCUUUUGCCAGAGCGGUCACAUAAUCAACCUGAAA… 7697 nt 0.4148
Summary

Enables mRNA 3'-UTR binding activity and translation factor activity, RNA binding. Involved in cellular response to amino acid stimulus and regulation of gene expression. Located in several cellular components, including cytosol; midbody; and nucleoplasm. Part of CCR4-NOT complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image