Basic Information
Symbol
CTC1
RNA Class
mRNA
Alias
CST telomere replication complex component 1
FLJ22170
AAF132
conserved telomere maintenance component 1
alpha accessory factor 132
conserved telomere capping protein 1
tmp494178
chromosome 17 open reading frame 68
CST telomere maintenance complex component 1
AAF-132
C17orf68
CRMCC
CST complex subunit CTC1
CTS telomere maintenance complex component 1
HBV DNAPTP1-transactivated protein B
Conserved telomere maintenance component 1
Location (GRCh38)
17:8224815-8248058
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_025099.6
Sequence length
7039 nt
GC Content
0.5343
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2551.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2678.64 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2315.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001411067.1 | GGGCGGAGCUCCGGCGCAUCAUGGCGGCUGGCCGGGCCCAGGUCCCUUC… | 6808 nt | 0.5323 |
| NM_025099.6 | GGGCGGAGCUCCGGCGCAUCAUGGCGGCUGGCCGGGCCCAGGUCCCUUC… | 7039 nt | 0.5343 |
Summary
This gene encodes a component of the CST complex. This complex plays an essential role in protecting telomeres from degradation. This protein also forms a heterodimer with the CST complex subunit STN1 to form the enzyme alpha accessory factor. This enzyme regulates DNA replication. Mutations in this gene are the cause of cerebroretinal microangiopathy with calcifications and cysts. Alternate splicing results in both coding and non-coding variants. [provided by RefSeq, Mar 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
