Basic Information
Symbol
CXCL2
RNA Class
mRNA
Alias
C-X-C motif chemokine ligand 2
SCYB2
GROb
MIP-2a
MGSA-b
CINC-2a
GRO2 oncogene
chemokine (C-X-C motif) ligand 2
GRO2
MIP2
MIP2A
C-X-C motif chemokine 2
MGSA beta
MIP2-alpha
gro-beta
growth-regulated protein beta
macrophage inflammatory protein 2-alpha
melanoma growth stimulatory activity beta
GROB
Growth-regulated protein beta
Gro-beta
Macrophage inflammatory protein 2-alpha
Location (GRCh38)
4:74097040-74099196
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002089.4
Sequence length
1115 nt
GC Content
0.4466
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-322.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-343.63 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
262.8
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002089.4 | ACAGAGCCCGGGCCACAGGCAGCUCCUUGCCAGCUCUCCUCCUCGCACA… | 1115 nt | 0.4466 |
Summary
This antimicrobial gene is part of a chemokine superfamily that encodes secreted proteins involved in immunoregulatory and inflammatory processes. The superfamily is divided into four subfamilies based on the arrangement of the N-terminal cysteine residues of the mature peptide. This chemokine, a member of the CXC subfamily, is expressed at sites of inflammation and may suppress hematopoietic progenitor cell proliferation. [provided by RefSeq, Sep 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
