Basic Information
Symbol
CYP2A6
RNA Class
mRNA
Alias
cytochrome P450 family 2 subfamily A member 6
CPA6
CYP2A
cytochrome P450, subfamily IIA (phenobarbital-inducible), polypeptide 6
cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6
CYP2A3
CYPIIA6
P450C2A
P450PB
cytochrome P450 2A6
1,4-cineole 2-exo-monooxygenase
coumarin 7-hydroxylase
cytochrome P450 IIA3
cytochrome P450(I)
flavoprotein-linked monooxygenase
xenobiotic monooxygenase
Cytochrome P450 2A6
Coumarin 7-hydroxylase
Cytochrome P450 IIA3
Cytochrome P450(I)
EC 1.14.14.-
EC 1.14.14.1
Location (GRCh38)
19:40843533-40850450
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000762.6
Sequence length
1761 nt
GC Content
0.5662
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-674.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-707.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
490.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000762.6 | AUCUAUCAUCCCACUACCACCAUGCUGGCCUCAGGGAUGCUUCUGGUGG… | 1761 nt | 0.5662 |
Summary
This gene, CYP2A6, encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. This protein localizes to the endoplasmic reticulum and its expression is induced by phenobarbital. The enzyme is known to hydroxylate coumarin, and also metabolizes nicotine, aflatoxin B1, nitrosamines, and some pharmaceuticals. Individuals with certain allelic variants are said to have a poor metabolizer phenotype, meaning they do not efficiently metabolize coumarin or nicotine. This gene is part of a large cluster of cytochrome P450 genes from the CYP2A, CYP2B and CYP2F subfamilies on chromosome 19q. The gene was formerly referred to as CYP2A3; however, it has been renamed CYP2A6. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
