Basic Information
Symbol
CYP51A1
RNA Class
mRNA
Alias
cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1
CP51
CYPL1
P450L1
LDM
P450-14DM
cytochrome P450, 51 (lanosterol 14-alpha-demethylase)
cytochrome P450, family 51, subfamily A, polypeptide 1
CYP51
lanosterol 14-alpha demethylase
CYPLI
cytochrome P450 51A1
cytochrome P450-14DM
cytochrome P45014DM
cytochrome P450LI
sterol 14-alpha demethylase
Lanosterol 14-alpha demethylase
Cytochrome P450 51A1
Cytochrome P450-14DM
Cytochrome P45014DM
Cytochrome P450LI
Sterol 14-alpha demethylase
EC 1.14.14.154
EC 1.14.13.70
Location (GRCh38)
7:92084987-92134803
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000786.4
Sequence length
3155 nt
GC Content
0.4105
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-917.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-975.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
725.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((...(((((...))))).(((((.........(((((((((((((((.((....)).))))))))))..)))))...((((((....((((((...((((((((..(((((((((((((......)))))))))((((..((((..(((.((((((((((.(.((((((((((((.((.(((((((.(((((((((.(..(........)..).)).)))))))))))))).)).)).))))))))))))))))))).)).)))(((((....))))).)))).))))(((.((.(((((...(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((..((.....)).)))))...)))))).))))....)))))..))....((((.((((((.((((((((((((.((((.(((..((....))..)))))))))..))).))))).....)).)))))).))))..(((((((((((..(.((((...........)))).)..)))))))))))...(((...(((((...)))))....))).((((((((.......))))))))(((..(((((((.((......)).))))))).)))....(((((((...........))))))))))))).....)).)))))))))))))))))......(((((.....(((.((((.....)))))))..))))).........(((..(((((((((..........(((..(((.(((.........))).).))..)))))))))))).))))))))))))))).)).)))(((((((......))))))).(((.((...((((.((((((((.(((((((.((.(((..((((((..(((((..............(((((..((((..((.((((.((((((((((((((.......(((((((...............((.((((((((.(((((((((((((..(((........)))...)))))))))))))....(((.((((.(((((((((...(((((...(((...)))....))))).)))....((((((.((((...................((((((((((((..........((((((.((....((((((((((((((((...((....((.((((((.....((((.(((((.((((((((((......(((((.....(((.....))))))))(((((((((((((((...((((((..((((..((((((.(((((.....((((.((((.(((.(((((((.....(((((((..(((...............)))...)))).))))))))))((((((..(((((((.(((.......((.....))))))))))))..)))))).(((((.((.((....)).)))))))........))).)))))))).....))))).((((........))))(((((.(((.....((((..(((((.....(((((((((..((((((((((((((....(((((((((((....))))))))))).....))).....)).))))))))).....).)))))))))))))..)))).....))).)))))....((((...)))).....)))))).(.(((((..((((((((..(((((((((........)))))...)))))))))))).))))).)(((((((((...((.....)).))))))))).......))))..)))))).((((((........))))))..))))))).....))))))))..))))))).)))...)))))))))))))))))....))...)))))))))))...)))))..)).))))))))))))))))))........(((((((.((....)).)))).))).)))).))))))..((((((((((......)))))))))).)))))))))))))..............(((((..(((((.....((((....)))).....)))))..)))))......)))))))))))))))))(((((((((((((((((.((.........(((..((((((((..(((((((.....))))))).(((((((((.......))).))))))((((........))))..((((((((.......((((....((((((...................)))))).)))).))))))))......(((((....)))))..(((...((((..(((((((...((((((....((((......((((((((((((.....))))))))))))..))))......))))))....))))))).))))...)))...(((((...)))))..)))))))).))))).))))))))))))..))))).......))))))))))))))...)))))).))))))))).((((.((((((((((((.((.......))))))))))..))))))))....((((...(((......)))...))))((((((....)))))).....(((....)))((((.(((((((((((............((((.(((((....))))))))).))))))))))))))))))))..))))))....(((((((...(((.((((....)))).)))...))))))).(((....))).........))))))))))))....(((((((.......))))))).((((((((((..................)).))))))))..................(((((((((......)))))))))......)))))))).))))....)).)))..........)))))))))))).))))))(((((.....)))))......((((((.((.((.............)).)).)))))))))))).......)))))...(((((((((((((.((((.((.(((....))))).)))).)).....((((............))))...(((....)))...........))))))))))).))))))))..(((((((((...........))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((((...(((((...))))).,((((.,,.||||{,(((,((((((((((.((....)).))))))))))}}))))}...{{{(((.,,.((((((...((((((((..(((((((((((((......)))))))))((((..((((..(((,((((((((((.(.((((((((((((.((.(((((((.(((((((((.,..{........}..}.)).)))))))))))))).)).)).))))))))))))))))))).)).)))|||((|{..},)))})))).)))){({.((.(((((...(((((((.((((((((((((((((((((((((((({((({(((((((((((,((((,..{{.....},.)))))...}))))).))))....}}}}|,,||{{{,((((,(((({{.{{(((((((({(.(({(((((,.((....)).,)))))))})..))).))))).....,,.}))))}.}}}}..{{|||||||||..{.{{{|.....,,,..,}}||.|..||}}}}}}})}..,|{{,,,|||{,,,.))))),,..}}}.{{((((((.......))))))}|(((..(((((((.((......)).))))))).}}},...(((((((...........)))))))}))))).....}).)))))))))))))))))......,,{,{,{,..{(,{((((.....)))))))..,},},..,,,,..,(((..(((((((((.,...,...,{,...,{{,..,...})}...}}}.,|,,.,})})}})))})).)}})))))))))))).)).})|(((((((......))))))),(((.((...((((.((((((((.(((((((.{(.(((({((((((..((((({,.....,,.....(((((..((((..{(,((((.((((((((((((((..{,...(((((((....,..........,,.(((((((,.(((((((((((((..(((........)))...)))))))))))))....(((.(((,{(((((((((...(((((...(((...)))....))))).)))....((((((.((((.,.................{{{(({{{{,,,(((((......))))),{,,{{{(((((((..,,,,..,{({({..(((((((((.,..........)))))..))))}}}}},,,..........(((((((((((((.{{{{{(({((((((({{(((.,,(({{((,,{{{{..{(((((,(((((.....((((.((({,(({.(((((({....,(((((((..(((...............)))...)))).)))))))))){(((({..(((((((.(((.......{{.....}}))))))))))..)))))}|||||{.{|,||,,..)),)))))})},..}},,))).,||||}||....,)}))).{{{{,,,,,...}}})|||||,{{{....{((,,(.(((...|.,.(((((((((.,((((((((({({{{....(((((((((((....))))))))))).....)}}.....)),})))))))}.....),}))))))).}.,.,}}.)..}}|,}}|,}}}}|{((.((((...})))}}}}.|||}}}..,|((((,.,{{{|||||.{{{,,(({{,{,...,,|||},||.,|||{}|||||}.|||},.,.|||{{|||}}.||}}..|}}.}})))))}},}}}...))}}..}})))}.((((((........)))))}..))})))).....)))))))).,|||,|||,}||.||||||||.},))))))},},,})}.,))))),)))))).)))))))....))))))))))}}}}}}}}}...,,,..(((((({.{{,...}),)))).))),)))).))))))..((((((((((......)))))))))).)))))))))))))......,,,,....(((((..(((((.....((((....)))).....)))))..)))))...,},)))))))))})))))))(((((((((((((((((.({........,(((..(((({({{..(((((((.....))))))).(((((((((.......))).))))))((((........))))..((((((((...,...{({{....((((((...................)))))),))}}.})))))))....,,((({{..,,)))),..(({...((((.,{((((((...((((((....{{{{......((((((((((((.....))))))))))))..))})......))))))....))))))).)))),,,|||,..(((((...)))))..}))))))),))))).))))))))))))..)))))...,,..))))))))))))))...))))}),))))))))).((((.((((((((((((.((.......))))))))))},)}},))))...{((((.,.(((......))).,.))))|(((((....)))))}.....(((....)))((((.(((((((((((............((((.(((((....))))))))).))))))))))))))))))))..)))))}(((.(((((((...(((.((((....)))).)))...)))))))))),,}}})),.,,,....,))}}})))))))....(((((({.......,)))))).(((((((({,,,,...............))}})))))))............||||,.{((((((((......))))))))),,,...)))))))).))))....)).)))..........)))})))))))).}))))),{{{{,.,,,)))}|,...,,{{{,{,....||,....}},.,},.,}.,,.}})))})))))}.......))}}}...((((((((((({{.(({{.{|,{{,....}}})).)))),)}....,{(({{{{{{{......,,})}}}|||,..,}},...........))))))))))).})))))))..{((((((((...........))))))))}.
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000786.4 | AGUAGGAGACCUGGGGCAAGGCCCCCUGUGGACGACCAUCUGCCAGCUU… | 3155 nt | 0.4105 |
| NM_001146152.2 | ACAGAGCGCGCCGUCGCCGCUCGAGCUCGCCCUGAGAUCCCUCCGCUCA… | 2988 nt | 0.3963 |
Summary
This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. This endoplasmic reticulum protein participates in the synthesis of cholesterol by catalyzing the removal of the 14alpha-methyl group from lanosterol. Homologous genes are found in all three eukaryotic phyla, fungi, plants, and animals, suggesting that this is one of the oldest cytochrome P450 genes. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
