Basic Information
Symbol
DCAF6
RNA Class
mRNA
Alias
DDB1 and CUL4 associated factor 6
PC326
IQ motif and WD repeats 1
1200006M05Rik
ARCAP
IQWD1
MSTP055
NRIP
DDB1- and CUL4-associated factor 6
IQ motif and WD repeat-containing protein 1
androgen receptor complex-associated protein
nuclear receptor interaction protein
Androgen receptor complex-associated protein
Nuclear receptor interaction protein
Location (GRCh38)
1:167935783-168076223
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001198956.2
Sequence length
3486 nt
GC Content
0.4426
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-995.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1061.71 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1034.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001349780.2 | GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… | 3151 nt | 0.4424 |
| NM_001393650.1 | GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… | 3255 nt | 0.4384 |
| NM_001393651.1 | GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… | 3315 nt | 0.4389 |
| NM_018442.4 | GGAUGUUCUGGUUAGUCUAAGAAGGAGAGUAUGAGGCGAGCUCCGGCCC… | 3273 nt | 0.4409 |
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary
The protein encoded by this gene is a ligand-dependent coactivator of nuclear receptors, including nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 (NR3C1), glucocorticoid receptor (GR), and androgen receptor (AR). The encoded protein and DNA damage binding protein 2 (DDB2) may act as tumor promoters and tumor suppressors, respectively, by regulating the level of androgen receptor in prostate tissues. In addition, this protein can act with glucocorticoid receptor to promote human papillomavirus gene expression. [provided by RefSeq, Mar 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
