Basic Information
Symbol
DENND2A
RNA Class
mRNA
Alias
DENN domain containing 2A
FAM31D
KIAA1277
DENN/MADD domain containing 2A
DENN domain-containing protein 2A
Location (GRCh38)
7:140518418-140673993
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_015689.5
Sequence length
3874 nt
GC Content
0.5787
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1522.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1590.1 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1045.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001318052.2 | GCAGAUCGUCGCGGAGCCACGGCAGGAGGAGGCAGGGGCCGCGGGCGAG… | 3772 nt | 0.5793 |
| NM_001318053.2 | GGCAUUUCCCUGCGGACUUCUGCUGUGCAGCCUGUGUUCCUUGACGGUG… | 3679 nt | 0.5401 |
| NM_001362678.2 | GAGUUCCCGCCUGGUCCCGGGACUGUGCAGAGCGCGAUCCAGGCGUUCC… | 3688 nt | 0.5613 |
| NM_015689.5 | GCAGAUCGUCGCGGAGCCACGGCAGGAGGAGGCAGGGGCCGCGGGCGAG… | 3874 nt | 0.5787 |
Summary
Enables guanyl-nucleotide exchange factor activity. Involved in retrograde transport, endosome to Golgi. Located in actin cytoskeleton. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
