Basic Information
Symbol
ADIPOQ
RNA Class
mRNA
Alias
adiponectin, C1Q and collagen domain containing
ACRP30
apM1
GBP28
adiponectin
adipose most abundant gene transcript 1
adiponectin precursor
adipocyte, C1Q and collagen domain containing
ACDC
ADIPQTL1
ADPN
APM-1
30 kDa adipocyte complement-related protein
adipocyte complement-related 30 kDa protein
adipose most abundant gene transcript 1 protein
adipose specific collagen-like factor
gelatin-binding protein 28
APM1
Adiponectin
Adipocyte complement-related 30 kDa protein
Adipocyte, C1q and collagen domain-containing protein
Adipose most abundant gene transcript 1 protein
apM-1
Gelatin-binding protein
Location (GRCh38)
3:186842704-186858463
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004797.4
Sequence length
4542 nt
GC Content
0.4392
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1350.48 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1435.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
892.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001177800.2 | AUUCUGACUGCAGUCUGUGGUUCUGAUUCCAUACCAGAGGAGACGGGAU… | 4593 nt | 0.4400 |
| NM_004797.4 | AUUCUGACUGCAGUCUGUGGUUCUGAUUCCAUACCAGAGGGGCUCAGGA… | 4542 nt | 0.4392 |
Summary
This gene is expressed in adipose tissue exclusively. It encodes a protein with similarity to collagens X and VIII and complement factor C1q. The encoded protein circulates in the plasma and is involved with metabolic and hormonal processes. Mutations in this gene are associated with adiponectin deficiency. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Apr 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
