Basic Information
Symbol
DLG1
RNA Class
mRNA
Alias
discs large MAGUK scaffold protein 1
SAP97
SAP-97
hdlg
DLGH1
dJ1061C18.1.1
discs large homolog 1
presynaptic protein SAP97
synapse-associated protein 97
discs, large homolog 1 (Drosophila)
discs large homolog 1, scribble cell polarity complex component
disks large homolog 1
Disks large homolog 1
Synapse-associated protein 97
hDlg
Location (GRCh38)
3:197042560-197299330
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001366207.1
Sequence length
4853 nt
GC Content
0.3804
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1189.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1290.38 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1528.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001366217.1 | AGCUCGGGGGCCGCCAUCUUGGCGGAAAGUUUCGGGGGAGAGCGGUUGG… | 5338 nt | 0.4194 |
| NM_001366218.1 | AGCUCGGGGGCCGCCAUCUUGGCGGAAAGUUUCGGGGGAGAGCGGUUGG… | 5401 nt | 0.4223 |
| NM_001366219.1 | AGCUCGGGGGCCGCCAUCUUGGCGGAAAGUUUCGGGGGAGAGCGGUUGG… | 5248 nt | 0.4192 |
| NM_001366220.1 | AGCUCGGGGGCCGCCAUCUUGGCGGAAAGUUUCGGGGGAGAGCGGUUGG… | 5182 nt | 0.4107 |
| NM_001366221.1 | AUUCACCACUCAGCAGCUGGUAGAGAAGUAAGCCUGCUUGGCAACCACC… | 4629 nt | 0.3841 |
| NM_001366222.1 | AUUCACCACUCAGCAGCUGGUAGAGAAGUAAGCCUGCUUGGCAACCACC… | 4593 nt | 0.3843 |
| NM_004087.2 | GUUGGAAACGGCACUGCUGAGUGAGGUUGAGGGGUGUCUCGGUAUGUGC… | 5034 nt | 0.3874 |
Showing 21 to 27 of 27 entries
Summary
This gene encodes a multi-domain scaffolding protein that is required for normal development. This protein may have a role in septate junction formation, signal transduction, cell proliferation, synaptogenesis and lymphocyte activation. A multitude of transcript variants deriving from alternative splicing and the use of multiple alternate promoter have been observed, including some splice variants that may be specific to brain and other tissues. An upstream uORF may regulate translation at some splice variants of this gene. [provided by RefSeq, Sep 2018]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
