Basic Information
Symbol
DLGAP4
RNA Class
mRNA
Alias
DLG associated protein 4
DAP4
KIAA0964
SAPAP4
discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 4
discs large homolog associated protein 4
DAP-4
DLP4
SAPAP-4
disks large-associated protein 4
PSD-95/SAP90-binding protein 4
SAP90/PSD-95-associated protein 4
Disks large-associated protein 4
Location (GRCh38)
20:36306302-36528637
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001365621.2
Sequence length
5058 nt
GC Content
0.6135
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2016.45 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2099.09 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1103.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001388277.1 | GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGUUCAU… | 2967 nt | 0.5709 |
| NM_001388278.1 | AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… | 3729 nt | 0.5806 |
| NM_014902.6 | GCAGCCGCAUCUGGGGCGCCGCGCCGGCCGGAGGAGAGGCAUGGGGCGC… | 5049 nt | 0.6136 |
| NM_183006.4 | AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… | 3738 nt | 0.5805 |
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary
The product of this gene is a membrane-associated guanylate kinase found at the postsynaptic density in neuronal cells. It is a signaling molecule that can interact with potassium channels and receptors, as well as other signaling molecules. The protein encoded by this gene can interact with PSD-95 through its guanylate kinase domain and may be involved in clustering PSD-95 in the postsynaptic density region. The encoded protein is one of at least four similar proteins that have been found. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
