Basic Information

Symbol
DMXL2
RNA Class
mRNA
Alias
Dmx like 2 RC3 KIAA0856 DFNA71 rabconnectin 3 DEE81 EIEE81 PEPNS dmX-like protein 2 rabconnectin-3 DmX-like protein 2 Rabconnectin-3

Secondary Structure

MANE Select
NM_001378457.1
Sequence length
10596 nt
GC Content
0.4082

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2884.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3096.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2887.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

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NM_001174117.3 AUUUCCGCAGCUGAGCGGCGACCCGGGCGGCGGCGGCGGUCGAGGAGCU… 8622 nt 0.4078
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NM_001378463.1 AUUUCCGCAGCUGAGCGGCGACCCGGGCGGCGGCGGCGGUCGAGGAGCU… 8249 nt 0.4089
NM_001378464.1 AUUUCCGCAGCUGAGCGGCGACCCGGGCGGCGGCGGCGGUCGAGGAGCU… 8208 nt 0.4106
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a protein with 12 WD domains. Proteins with WD domains are involved in many functions including participation in signal transduction pathways. Participation of the encoded protein in regulation of the Notch signaling pathway has been demonstrated in vitro using several human cell lines (PMID:20810660). A gene encoding a similar protein is located on chromosome 5. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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