Basic Information
Symbol
DNAJC6
RNA Class
mRNA
Alias
DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6
KIAA0473
PARK19
auxilin
DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 6
DJC6
DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 6
putative tyrosine-protein phosphatase auxilin
Auxilin
DnaJ homolog subfamily C member 6
EC 3.1.3.-
Location (GRCh38)
1:65248219-65415871
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001256864.2
Sequence length
5962 nt
GC Content
0.4309
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1702.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1816.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1568.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001256864.2 | GAGCCGAGCUCAGCCCAGGGCGGCGGCUUCGCCUCGCCCGGCGAAGCUU… | 5962 nt | 0.4309 |
| NM_001256865.2 | AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… | 5863 nt | 0.4228 |
| NM_014787.4 | AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… | 5750 nt | 0.4224 |
Summary
DNAJC6 belongs to the evolutionarily conserved DNAJ/HSP40 family of proteins, which regulate molecular chaperone activity by stimulating ATPase activity. DNAJ proteins may have up to 3 distinct domains: a conserved 70-amino acid J domain, usually at the N terminus, a glycine/phenylalanine (G/F)-rich region, and a cysteine-rich domain containing 4 motifs resembling a zinc finger domain (Ohtsuka and Hata, 2000 [PubMed 11147971]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
