Basic Information

Symbol
DNAJC6
RNA Class
mRNA
Alias
DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 KIAA0473 PARK19 auxilin DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 6 DJC6 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 6 putative tyrosine-protein phosphatase auxilin Auxilin DnaJ homolog subfamily C member 6 EC 3.1.3.-

Secondary Structure

MANE Select
NM_001256864.2
Sequence length
5962 nt
GC Content
0.4309

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1702.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1816.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1568.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001256864.2 GAGCCGAGCUCAGCCCAGGGCGGCGGCUUCGCCUCGCCCGGCGAAGCUU… 5962 nt 0.4309
NM_001256865.2 AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… 5863 nt 0.4228
NM_014787.4 AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… 5750 nt 0.4224
Summary

DNAJC6 belongs to the evolutionarily conserved DNAJ/HSP40 family of proteins, which regulate molecular chaperone activity by stimulating ATPase activity. DNAJ proteins may have up to 3 distinct domains: a conserved 70-amino acid J domain, usually at the N terminus, a glycine/phenylalanine (G/F)-rich region, and a cysteine-rich domain containing 4 motifs resembling a zinc finger domain (Ohtsuka and Hata, 2000 [PubMed 11147971]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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