Basic Information

Symbol
DYNC2H1
RNA Class
mRNA
Alias
dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 hdhc11 DHC2 DHC1b DYH1B dynein, cytoplasmic, heavy polypeptide 2 ATD3 DNCH2 SRPS2B SRTD3 cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 dynein cytoplasmic heavy chain 2 dynein heavy chain 11 dynein heavy chain, isotype 1B DHC1B KIAA1997 Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 Cytoplasmic dynein 2 heavy chain Dynein cytoplasmic heavy chain 2 Dynein heavy chain 11 hDHC11 Dynein heavy chain isotype 1B
Location (GRCh38)
11:103109410-103479863 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001080463.2
BLAST PRIMER
NM_001377.3
BLAST PRIMER
NM_024606.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001377.3
Sequence length
13683 nt
GC Content
0.3835

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3520.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3799.01 kcal/mol
Frequency: 4.02e-197
Diversity: 3785.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001080463.2 AUAGCGACUACCCCUGGCAACCGCGAAGCUCUGCGGUCCCGCGGUCGGG… 13704 nt 0.3834
NM_001377.3 AUAGCGACUACCCCUGGCAACCGCGAAGCUCUGCGGUCCCGCGGUCGGG… 13683 nt 0.3835
Summary

This gene encodes a large cytoplasmic dynein protein that is involved in retrograde transport in the cilium and has a role in intraflagellar transport, a process required for ciliary/flagellar assembly. Mutations in this gene cause a heterogeneous spectrum of conditions related to altered primary cilium function and often involve polydactyly, abnormal skeletogenesis, and polycystic kidneys. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct proteins. [provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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