Basic Information

Symbol
EIF1AY
RNA Class
mRNA
Alias
eukaryotic translation initiation factor 1A Y-linked eukaryotic translation initiation factor 1A, Y chromosome eIF-4C eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal eIF1A Y isoform eukaryotic translation initiation factor 4C Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal eIF-1A Y isoform Eukaryotic translation initiation factor 4C
Location (GRCh38)
Y:20575694-20593154 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001278612.2
BLAST PRIMER
NM_004681.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_004681.4
Sequence length
1339 nt
GC Content
0.3458

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-303.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -330.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001278612.2 GCGCACCCACCUGCUGCAUCUUAGUUCAGUCGGCUCUUAGAGUAGUAAC… 1288 nt 0.3447
NM_004681.4 GCGCACCCACCUGCUGCAUCUUAGUUCAGUCGGCUCUUAGAGUAGUAAC… 1339 nt 0.3458
Summary

This gene is located on the non-recombining region of the Y chromosome. It encodes a protein related to eukaryotic translation initiation factor 1A (EIF1A), which may function in stabilizing the binding of the initiator Met-tRNA to 40S ribosomal subunits. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image