Basic Information
Symbol
EIF2D
RNA Class
mRNA
Alias
eukaryotic translation initiation factor 2D
LGTN
HCA56
hepatocellular carcinoma-associated antigen 56
ligatin
Eukaryotic translation initiation factor 2D
eIF2d
Hepatocellular carcinoma-associated antigen 56
Ligatin
Location (GRCh38)
1:206571292-206612514
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_006893.3
Sequence length
2011 nt
GC Content
0.5206
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-691.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-726.4 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
464.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001201478.2 | CCUUUUCGCGGCCGGGCCCCAGCAUGGCUGCCCCCACGGCUGAGGGCCU… | 1639 nt | 0.5168 |
| NM_006893.3 | CCUUUUCGCGGCCGGGCCCCAGCAUGGCUGCCCCCACGGCUGAGGGCCU… | 2011 nt | 0.5206 |
Summary
This gene encodes a translation initiation factor involved in the recruitment and delivery of aminoacyl-tRNAs to the P-site of the eukaryotic ribosome in a GTP-independent manner. This gene was previously referred to as ligatin, but is now known to localize to the cytoplasm and localize and function with translation factors. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
