Basic Information

Symbol
ELP3
RNA Class
mRNA
Alias
elongator acetyltransferase complex subunit 3 FLJ10422 KAT9 elongation protein 3 homolog (S. cerevisiae) elongator complex protein 3 elongation protein 3 homolog protein lysine acetyltransferase ELP3 tRNA uridine(34) acetyltransferase Elongator complex protein 3 hELP3 EC 2.3.1.311 EC 2.3.1.48

Secondary Structure

MANE Select
NM_018091.6
Sequence length
3148 nt
GC Content
0.4705

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-964.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1022.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001284222.2 GAAGCUUCAGGAGACCUAUCCUCAUCUGUGCAAGGAGGAGUGGCCAACU… 3154 nt 0.4705
NM_001284224.2 GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 2945 nt 0.4672
NM_001284225.2 GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 2984 nt 0.4715
NM_001284226.2 GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 3009 nt 0.4673
NM_018091.6 GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 3148 nt 0.4705
Summary

Enables acetyltransferase activity and phosphorylase kinase regulator activity. Involved in regulation of transcription by RNA polymerase II and tRNA wobble uridine modification. Located in cytosol and nucleolus. Part of elongator holoenzyme complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image