Basic Information

Symbol
EPHB4
RNA Class
mRNA
Alias
EPH receptor B4 Tyro11 EphB4 CMAVM2 HFASD HTK LMPHM7 MYK1 ephrin type-B receptor 4 ephrin receptor EphB4 hepatoma transmembrane kinase tyrosine-protein kinase TYRO11 tyrosine-protein kinase receptor HTK TYRO11 Ephrin type-B receptor 4 Hepatoma transmembrane kinase Tyrosine-protein kinase TYRO11 EC 2.7.10.1 EC 2.7.10
Location (GRCh38)
7:100802563-100827555 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_004444.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_004444.5
Sequence length
4353 nt
GC Content
0.6265

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1939.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2013.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1180.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_004444.5 AGUUCCAGCGCAGCUCAGCCCCUGCCCGGCCCGGCCCGCCCGGCUCCGC… 4353 nt 0.6265
Summary

Ephrin receptors and their ligands, the ephrins, mediate numerous developmental processes, particularly in the nervous system. Based on their structures and sequence relationships, ephrins are divided into the ephrin-A (EFNA) class, which are anchored to the membrane by a glycosylphosphatidylinositol linkage, and the ephrin-B (EFNB) class, which are transmembrane proteins. The Eph family of receptors are divided into 2 groups based on the similarity of their extracellular domain sequences and their affinities for binding ephrin-A and ephrin-B ligands. Ephrin receptors make up the largest subgroup of the receptor tyrosine kinase (RTK) family. The protein encoded by this gene binds to ephrin-B2 and plays an essential role in vascular development. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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