Basic Information

Symbol
EPO
RNA Class
mRNA
Alias
erythropoietin EP DBAL ECYT5 MVCD2 epoetin Erythropoietin Epoetin
Location (GRCh38)
7:100720468-100723700 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000799.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000799.4
Sequence length
1662 nt
GC Content
0.6396

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-679.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -707.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 479.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((.(((.((....(((((((((...(((.....)))((((((..((((..(((........)))...))))))))))((((((.(((............(((((.(((((((((.(......).))))......((((((((((((.(((((...((.....((((.(((.........))).)))).....(((((.(((((.((((((((((((((((((((..(((....))).((..(((((..((.....(((((((.((.((.((((..(((((....)))))..)))))).)).))).))))...)).)))))..)).((((((.(((.((((((....)).)))).)))))))))((((((.((((((((((..............))))))((((.(((((((((........))).)))))).))))....))))...))))))((((.(((((((.(((...)))))))).))))))........)))))).).))))))))......((((((((..(((.(((((((((.........((....))....(((((((.((((((.(((((((((((((....(((((.((((.(((......))).)))))))))......))).)))....(((((.(.(((..(((((((((.((........((((((((((....(((.....))).(((((..(((......))).((((((((.(((.....))))))))))).)))))(((((........(.((((((((((((((((((((.(.(((...))).)..)))))))))))))))))))).).....((((((....))))))..)))))))))))).))).....))))))).))))..))).).)))))........)).)))))..))))))))))))).)))))))))(((((((...(.((((((.((((((..(((...(((.........(((.((.....)).))).((((....))))................)))))).)))))).)))))))..)))))))))).))))))))))))).))(((.(((((((....))))))).))).........................))))))))......((((...((...(((((......((((((((((((((..(((((((...(((((((((.(((.(((....))))))....((((((((..((..((((((...((........))...))))).)..))..))))))))..(((((........))))).(((...(((((............)))))...))).))))))).))..)))))))..)).....)))))).)))))).....(((........))))))))...))...))))((((...........))))......)).))))).))))))).)))))........)).)))..)))))(((((....)))))....)))))))))((((.((((((((.((((......)))).)))))))).))))....((.((....))))...)))))))))...))))).)).))))).....((((((.((..(((((((.....))))..)))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{(((((.(((.{{....(((((((((..{(((.....,}}((((((..((((..(((........)))...)))))))))){{{{{{.{{{........{{,,{(({{.{{(((((({.({,,,,,|.}}||,,....{{||||{{{{((,(({(({((((.....((((.(((.........))).)))).....((.(((((((..,,...(((((((((((((((..(({....}))........(({,,{.....|))|,.{.((((..(.((((((.(((.(((..((..({.|((((.(.((.(((((((((.(((((({,,.((((({{(({.((((((....}}.)))).}))))))))...,,|.|,,,{,,|||}}}}.{{{{{{...,,,,}}({{(.(({(({(((........)))},)))}},))))..))))))...))))))))))),}))))).)}}}..))).))).))))))}.)))),.,)))))).).))))))))...{|..,||.|||..))))))))).,{((((((((((({,(..((({(,(((((({{((((((.(((((((({{{{{....(((((.((((.(((......))).}))))))))......})).}})...{(((((,(.({{..{{((((((((((.......,(({(((((((....{((.....))},(({((,.{((......,|,..{((((((.(((,,...}}}})))}}))}))))}{((((,.{,{{,.(.((((((((((((((((((((.{.(((...))).)..)))))))))))))))))))).}..,,,|(((((....)))))}..}})))))))))),))).....))))))).)))),.))).}.)))))........))}}))))..))))))))))))).)),}))..,(((((((...{.((((((.((((((..{{{.,,{,(,........(((.((.....)).))).{{{{....))))..........,,,,...})))}.)))))).)))))),..)))))))}...|||||}|||||||,,.{({.{((((((....))))))|{|||{..{,...................,}..)))))}....{((({...((...(((((...,,,{((((({((((({{.,(((((((...(((((((((.{((.(((....))))))....((((((((..(({.{(((((...((.,....,.))...))))).}.}))..))))))))..(((((........))))).(((...(((((.|||...}}}..)))))...))).))))))).))..)))))))..)).,,..)))))).))))))..,,,(((........)))))))}...}}...}}))|{{{....,,,,,..)}))......},.))))),)))))}|,|||||,.......||,}||..}}))){||||.,,,))))).,,.)))))})))||{,.{{{{(({(,({{{.,,,.,)}}).)}))))))}))))}}..,{.||..,.},}}.,,)))))))))...})))).)).)))||{...{((((({{,,.....,,,......,,,)}})))))),..)),.....

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000799.4 CCUUUCCCAGAUAGCACGCUCCGCCAGUCCCAAGGGUGCGCAACCGGCU… 1662 nt 0.6396
Summary

This gene encodes a secreted, glycosylated cytokine composed of four alpha helical bundles. The encoded protein is mainly synthesized in the kidney, secreted into the blood plasma, and binds to the erythropoietin receptor to promote red blood cell production, or erythropoiesis, in the bone marrow. Expression of this gene is upregulated under hypoxic conditions, in turn leading to increased erythropoiesis and enhanced oxygen-carrying capacity of the blood. Expression of this gene has also been observed in brain and in the eye, and elevated expression levels have been observed in diabetic retinopathy and ocular hypertension. Recombinant forms of the encoded protein exhibit neuroprotective activity against a variety of potential brain injuries, as well as antiapoptotic functions in several tissue types, and have been used in the treatment of anemia and to enhance the efficacy of cancer therapies. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image