Basic Information

Symbol
ERCC4
RNA Class
mRNA
Alias
ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit RAD1 FANCQ xeroderma pigmentosum, complementation group F excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4 excision repair cross-complementation group 4 ERCC11 XFEPS XPF DNA repair endonuclease XPF DNA excision repair protein ERCC-4 DNA repair protein complementing XP-F cells excision-repair, complementing defective, in Chinese hamster xeroderma pigmentosum group F-complementing protein Xeroderma pigmentosum group F-complementing protein EC 3.1.-.-
Location (GRCh38)
16:13920138-13952348 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_005236.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_005236.3
Sequence length
6764 nt
GC Content
0.3995

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1915.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2045.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1695.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_005236.3 GGAAGAGCUUCCAUGGAGUCAGGGCAGCCGGCUCGACGGAUUGCCAUGG… 6764 nt 0.3995
Summary

The protein encoded by this gene forms a complex with ERCC1 and is involved in the 5' incision made during nucleotide excision repair. This complex is a structure specific DNA repair endonuclease that interacts with EME1. Defects in this gene are a cause of xeroderma pigmentosum complementation group F (XP-F), or xeroderma pigmentosum VI (XP6).[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image